More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00760  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 
445 aa  911  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1641  diaminopimelate decarboxylase  58.12 
 
 
420 aa  515  1e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  57.45 
 
 
416 aa  512  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.6198e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0628  diaminopimelate decarboxylase  56.03 
 
 
420 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3249  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.53 
 
 
421 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.39 
 
 
413 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1355  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.85 
 
 
421 aa  405  1e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14691e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  47.61 
 
 
419 aa  406  1e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0299  diaminopimelate decarboxylase  48.2 
 
 
417 aa  407  1e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000126182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0302  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.99 
 
 
419 aa  406  1e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28180  diaminopimelate decarboxylase  46.68 
 
 
432 aa  404  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000200142  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.17 
 
 
421 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2135  diaminopimelate decarboxylase  50.36 
 
 
418 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.29469e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0514  Diaminopimelate decarboxylase  46.12 
 
 
434 aa  366  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  33.89 
 
 
430 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  33.8 
 
 
429 aa  199  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  31.73 
 
 
402 aa  199  8e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  35.29 
 
 
430 aa  191  3e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  28.85 
 
 
398 aa  189  6e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  30.8 
 
 
433 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  33.1 
 
 
430 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 
409 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  28.74 
 
 
407 aa  181  3e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 
425 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  3.35873e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 
416 aa  174  2e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 
419 aa  174  2e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  31.64 
 
 
417 aa  174  3e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  27.16 
 
 
416 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 
406 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  31.2 
 
 
386 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  1.62613e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 
418 aa  166  6e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  29.22 
 
 
435 aa  166  1e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  32.77 
 
 
412 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  28.85 
 
 
406 aa  164  4e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  30.07 
 
 
420 aa  164  4e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  29.23 
 
 
382 aa  163  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  31.36 
 
 
466 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  31.3 
 
 
386 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  30.95 
 
 
421 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  32.63 
 
 
440 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  29.95 
 
 
421 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  30.64 
 
 
415 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  30.66 
 
 
423 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  30.86 
 
 
414 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  30.1 
 
 
434 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  31.07 
 
 
415 aa  157  5e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  30.41 
 
 
423 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 
424 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  30.89 
 
 
461 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  31.49 
 
 
407 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  30.83 
 
 
415 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  30.19 
 
 
402 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  30.99 
 
 
415 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  31.75 
 
 
417 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  27.74 
 
 
410 aa  154  3e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  30.19 
 
 
402 aa  154  3e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  30.19 
 
 
402 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  2.31454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  31.7 
 
 
422 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  29.15 
 
 
434 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  30.24 
 
 
420 aa  153  6e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  30.24 
 
 
434 aa  153  6e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  27.86 
 
 
859 aa  153  6e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  31.67 
 
 
421 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  29.23 
 
 
412 aa  152  9e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 
445 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  4.93249e-06  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  30.38 
 
 
421 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2691  diaminopimelate decarboxylase  30.12 
 
 
419 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 
417 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  26.84 
 
 
859 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  29.16 
 
 
418 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  27.43 
 
 
417 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  30.38 
 
 
421 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  31.32 
 
 
453 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  30.1 
 
 
418 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  30.19 
 
 
451 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  32.08 
 
 
878 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  29.45 
 
 
436 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2123  diaminopimelate decarboxylase  31.93 
 
 
422 aa  149  1e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  28.1 
 
 
434 aa  148  2e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  31.65 
 
 
415 aa  148  2e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  31.93 
 
 
422 aa  148  2e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  29.47 
 
 
399 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  31.34 
 
 
420 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  29.83 
 
 
425 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  29.09 
 
 
423 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  31.34 
 
 
420 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.10406e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  31.34 
 
 
420 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  31.34 
 
 
420 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  31.24 
 
 
420 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  29.59 
 
 
422 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  29.93 
 
 
419 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  28.5 
 
 
436 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  31 
 
 
420 aa  146  7e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  31.24 
 
 
420 aa  146  7e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  29.22 
 
 
436 aa  146  8e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  31 
 
 
420 aa  146  8e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  31 
 
 
420 aa  146  8e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  31 
 
 
420 aa  146  8e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0317  diaminopimelate decarboxylase  29.54 
 
 
461 aa  146  8e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.241285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  31 
 
 
420 aa  146  8e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>