21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06380  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00670  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0069  hypothetical protein  62.1 
 
 
136 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1012  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.23 
 
 
138 aa  160  5e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230309 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  56.25 
 
 
322 aa  152  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  56.82 
 
 
352 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0254  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.94 
 
 
142 aa  149  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1024  hypothetical protein  56.35 
 
 
150 aa  147  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47673  normal  0.0221645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30430  hypothetical protein  56.15 
 
 
136 aa  145  2e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.154496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1537  hypothetical protein  52.31 
 
 
148 aa  137  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44 
 
 
135 aa  115  2e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09050  hypothetical protein  42.96 
 
 
142 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2385  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.24 
 
 
156 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0955  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
123 aa  47.4  8e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1588  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.79 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1828  glyoxalase family protein  28.89 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0415399  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1900  glyoxalase family protein  28.89 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3475  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3256  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.19 
 
 
128 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0371  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.72 
 
 
152 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.349547 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2631  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>