178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  100 
 
 		 1270 aa  2519    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  43.79 
 
 		 1250 aa  812    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  41.75 
 
 		 1143 aa  740    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  44.05 
 
 		 1228 aa  785    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  38.4 
 
 		 1247 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  40.95 
 
 		 1215 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1215 aa  711    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  41.75 
 
 		 1143 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  41.73 
 
 		 1151 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  41.75 
 
 		 1143 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  41.2 
 
 		 1163 aa  772    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  41.85 
 
 		 1139 aa  789    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  39.75 
 
 		 1350 aa  708    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  40.92 
 
 		 1196 aa  729    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  43.6 
 
 		 1324 aa  588  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  38.26 
 
 		 1153 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  35.5 
 
 		 1198 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1116 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1126 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1175 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  39.15 
 
 		 522 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  44.78 
 
 		 1082 aa  270  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1172 aa  246  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  36.55 
 
 		 1118 aa  244  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1121 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  45.09 
 
 		 1280 aa  231  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.7 
 
 		 606 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29.76 
 
 		 1271 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.03 
 
 		 902 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.77 
 
 		 752 aa  101  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1259 aa  100  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.8 
 
 		 934 aa  100  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1275 aa  97.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.5 
 
 		 585 aa  97.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.02 
 
 		 986 aa  96.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  27.25 
 
 		 902 aa  91.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.89 
 
 		 1255 aa  89  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.43 
 
 		 553 aa  89.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.43 
 
 		 553 aa  89.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.29 
 
 		 636 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  28.08 
 
 		 1427 aa  86.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.06 
 
 		 1048 aa  85.1  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.88 
 
 		 1189 aa  85.1  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.11 
 
 		 952 aa  84.7  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25.97 
 
 		 486 aa  84.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.47 
 
 		 633 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  30.68 
 
 		 754 aa  82.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.18 
 
 		 716 aa  82  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  29.17 
 
 		 650 aa  81.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.87 
 
 		 636 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.48 
 
 		 1077 aa  79.7  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.16 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.68 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  29.17 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  26.29 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25 
 
 		 1038 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.4 
 
 		 901 aa  77.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.52 
 
 		 479 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  27.98 
 
 		 466 aa  77.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.29 
 
 		 1090 aa  76.3  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.09 
 
 		 611 aa  75.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.73 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.54 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  22.05 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.07 
 
 		 633 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  20.63 
 
 		 487 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  25.94 
 
 		 2245 aa  73.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  27.43 
 
 		 659 aa  73.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.74 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  23.29 
 
 		 1097 aa  72.8  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  27.97 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.54 
 
 		 651 aa  72  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.62 
 
 		 629 aa  71.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.89 
 
 		 1111 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0258  hypothetical protein  26.84 
 
 		 502 aa  70.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.715645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24981  RecB family nuclease  27.5 
 
 		 535 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 		 1196 aa  69.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.56 
 
 		 1999 aa  68.6  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  27.14 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  31.87 
 
 		 619 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  28.65 
 
 		 1651 aa  67.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.17 
 
 		 1620 aa  67  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  24.77 
 
 		 493 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  24.77 
 
 		 493 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.41 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  24.3 
 
 		 797 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  25.91 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  23.54 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  31.5 
 
 		 622 aa  66.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.31 
 
 		 914 aa  66.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  40.8 
 
 		 193 aa  66.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  25.99 
 
 		 643 aa  65.9  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  31.5 
 
 		 622 aa  65.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.02 
 
 		 1585 aa  65.1  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.02 
 
 		 1585 aa  65.1  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.15 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.7 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 436 aa  64.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000132526 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.39 
 
 		 655 aa  64.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5628  hypothetical protein  30.48 
 
 		 404 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431962  normal  0.25929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>