More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  100 
 
 
499 aa  982  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  61.2 
 
 
486 aa  563  1e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  65.03 
 
 
493 aa  556  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  62.84 
 
 
485 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  59.53 
 
 
486 aa  535  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  61.46 
 
 
474 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  59.96 
 
 
544 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  56.56 
 
 
487 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  55.16 
 
 
497 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  57.08 
 
 
479 aa  468  1e-130  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  53.21 
 
 
504 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  56.31 
 
 
482 aa  458  1e-128  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  54.71 
 
 
496 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  56.4 
 
 
469 aa  454  1e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  56.24 
 
 
479 aa  454  1e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  53.04 
 
 
478 aa  441  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  52.31 
 
 
472 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  54.68 
 
 
492 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  52.5 
 
 
475 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  54.12 
 
 
490 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  54.68 
 
 
492 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  55.41 
 
 
491 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  54.68 
 
 
492 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  54.21 
 
 
494 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  50.65 
 
 
480 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  48.3 
 
 
466 aa  417  1e-115  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  48.83 
 
 
468 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  48.45 
 
 
480 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  49.57 
 
 
474 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  49.67 
 
 
468 aa  400  1e-110  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  52.52 
 
 
479 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  47.39 
 
 
470 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.23251e-05  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  36 
 
 
491 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  35.93 
 
 
491 aa  305  1e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  35.93 
 
 
491 aa  305  2e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  35.93 
 
 
491 aa  305  2e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  35.93 
 
 
491 aa  305  2e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  35.93 
 
 
491 aa  305  2e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  35.93 
 
 
491 aa  305  2e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  35.8 
 
 
491 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  35.71 
 
 
448 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  37.26 
 
 
468 aa  283  5e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  39.22 
 
 
450 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  36.36 
 
 
466 aa  273  5e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  37.34 
 
 
442 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  8.23269e-06 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  37.04 
 
 
467 aa  269  9e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  33.75 
 
 
485 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  32.77 
 
 
475 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  35.56 
 
 
438 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  36.23 
 
 
457 aa  256  1e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  32.25 
 
 
448 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  3.05958e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  29.42 
 
 
477 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  35.14 
 
 
464 aa  245  1e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  35.5 
 
 
477 aa  244  2e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.77 
 
 
457 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  34.32 
 
 
492 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  34.55 
 
 
480 aa  243  4e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  31.91 
 
 
524 aa  243  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.65 
 
 
516 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  32.43 
 
 
458 aa  239  7e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  9.61132e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  35.65 
 
 
445 aa  239  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  35.37 
 
 
475 aa  237  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.19 
 
 
484 aa  235  2e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.48 
 
 
480 aa  233  8e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.4 
 
 
463 aa  232  9e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.4 
 
 
463 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  33.55 
 
 
443 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  33.05 
 
 
444 aa  227  5e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  33.4 
 
 
437 aa  226  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.26 
 
 
480 aa  226  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  31.73 
 
 
450 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  33.63 
 
 
468 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  34.63 
 
 
430 aa  223  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  32.63 
 
 
468 aa  221  2e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  33.68 
 
 
472 aa  220  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  34.64 
 
 
474 aa  219  8e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  29.69 
 
 
529 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  32.77 
 
 
476 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  33.48 
 
 
446 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.28 
 
 
482 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  32 
 
 
441 aa  216  1e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  32.75 
 
 
459 aa  213  6e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.03 
 
 
533 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  32.76 
 
 
497 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  29.94 
 
 
518 aa  210  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  32.24 
 
 
471 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.13 
 
 
468 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  31.48 
 
 
471 aa  206  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  7.49242e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  33.12 
 
 
443 aa  206  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  30.75 
 
 
507 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  32.16 
 
 
480 aa  198  2e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  32.55 
 
 
452 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  32.55 
 
 
452 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  30.11 
 
 
522 aa  196  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  31.22 
 
 
452 aa  196  8e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  30.58 
 
 
490 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  33.19 
 
 
447 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  32.42 
 
 
464 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  32.42 
 
 
464 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  32.42 
 
 
464 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>