128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 
76 aa  158  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  73.68 
 
 
76 aa  123  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  65.33 
 
 
75 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  3.35476e-12 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  58.67 
 
 
75 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  58.67 
 
 
75 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  60.27 
 
 
74 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  60 
 
 
73 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  58.11 
 
 
75 aa  97.1  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  54.17 
 
 
74 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  54.17 
 
 
74 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  34.67 
 
 
74 aa  62  3e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  33.8 
 
 
79 aa  60.8  7e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  2.07986e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  33.8 
 
 
79 aa  60.8  7e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.08198e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  37.14 
 
 
80 aa  60.5  8e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  33.8 
 
 
77 aa  59.7  1e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  35.21 
 
 
76 aa  59.3  2e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  33.78 
 
 
75 aa  58.5  3e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  33.33 
 
 
78 aa  56.6  1e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.86624e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.43 
 
 
73 aa  53.9  7e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  42.42 
 
 
101 aa  52.4  2e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  42.42 
 
 
75 aa  52.8  2e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  52.8  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  30.43 
 
 
70 aa  52  3e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  31.88 
 
 
70 aa  52  3e-06  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  35.48 
 
 
75 aa  52  3e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  51.2  4e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  51.2  4e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  51.2  4e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  51.2  4e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  51.2  5e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  33.8 
 
 
85 aa  51.2  5e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  29.58 
 
 
81 aa  50.8  6e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  37.7 
 
 
79 aa  50.4  9e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  34.43 
 
 
78 aa  49.7  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  34.43 
 
 
75 aa  50.1  1e-05  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  32.26 
 
 
75 aa  49.7  1e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  32.26 
 
 
75 aa  49.7  1e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  37.7 
 
 
89 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  37.7 
 
 
89 aa  49.3  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  25.35 
 
 
80 aa  49.3  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  31.94 
 
 
82 aa  49.3  2e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  37.7 
 
 
89 aa  49.3  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  30.43 
 
 
70 aa  48.1  4e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  32.86 
 
 
75 aa  48.1  4e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.69274e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  34.72 
 
 
78 aa  48.1  4e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  24.32 
 
 
82 aa  47  8e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.8775e-05  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.65 
 
 
76 aa  47  9e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.35779e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  5.20309e-06 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  28 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.26 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  32.43 
 
 
73 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  30.65 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17975e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  30.99 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  36.07 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  28.57 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  36.11 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  37.5 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  29.73 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  29.73 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  1.96179e-11 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  36.36 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  29.73 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  29.73 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  32.26 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  34.33 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.96514e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  31.75 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  35.94 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  34.43 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  35.71 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  32.2 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  35.82 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  29.73 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  40.38 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  31.43 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  26.09 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  32.39 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.93639e-08 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  29.03 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  29.03 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3042e-14 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  43.5  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  29.03 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>