157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00550 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  100 
 
 
385 aa  736  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  56.82 
 
 
375 aa  351  9e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  56.77 
 
 
359 aa  349  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  50.46 
 
 
344 aa  309  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  46.8 
 
 
352 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  46.8 
 
 
352 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  46.51 
 
 
352 aa  304  1e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.22 
 
 
352 aa  303  3e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  45.93 
 
 
352 aa  303  4e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  8.97604e-12 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  46.51 
 
 
352 aa  302  6e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  47.09 
 
 
349 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  41.74 
 
 
359 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  41.74 
 
 
359 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.00553e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.29 
 
 
334 aa  284  2e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  45.23 
 
 
343 aa  267  3e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  31.23 
 
 
355 aa  150  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.07 
 
 
332 aa  132  8e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.12803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.49 
 
 
330 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  4.13537e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  30.83 
 
 
371 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.99 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  31.4 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  30.06 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.4 
 
 
412 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  41.84 
 
 
103 aa  94  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  29.36 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.98 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.45 
 
 
409 aa  89.4  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.4 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.5 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.33 
 
 
354 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.34 
 
 
400 aa  83.6  5e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.79 
 
 
400 aa  83.6  5e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  26.67 
 
 
357 aa  81.6  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.05 
 
 
368 aa  80.9  3e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.64 
 
 
215 aa  80.9  4e-14  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  29.56 
 
 
373 aa  79.3  1e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  27.68 
 
 
352 aa  79.3  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.13 
 
 
371 aa  79.3  1e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.45 
 
 
373 aa  78.6  2e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.84 
 
 
216 aa  76.3  9e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  39.81 
 
 
423 aa  75.5  1e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  41.51 
 
 
401 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  41.51 
 
 
401 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  41.51 
 
 
401 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  41.51 
 
 
401 aa  74.7  3e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  41.51 
 
 
401 aa  74.3  3e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.51 
 
 
401 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  30.55 
 
 
371 aa  74.7  3e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  41.51 
 
 
401 aa  74.3  3e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  28.49 
 
 
371 aa  74.3  3e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  41.75 
 
 
404 aa  73.6  5e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  41.75 
 
 
404 aa  73.6  5e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  41.75 
 
 
404 aa  73.6  6e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  42.31 
 
 
404 aa  73.6  6e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  41.75 
 
 
404 aa  73.2  7e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  41.75 
 
 
404 aa  73.2  7e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  41.75 
 
 
404 aa  73.2  7e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  29.8 
 
 
348 aa  72.8  9e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.24 
 
 
347 aa  72.4  1e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  45.36 
 
 
404 aa  72.8  1e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  40.95 
 
 
404 aa  72.4  1e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  42.72 
 
 
401 aa  72.4  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  42.72 
 
 
401 aa  72.4  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  42.72 
 
 
401 aa  72.4  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  42.72 
 
 
401 aa  72.4  1e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  3.23853e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  41.9 
 
 
403 aa  72.4  1e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  44.33 
 
 
401 aa  72  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  39.62 
 
 
404 aa  71.6  2e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  39.62 
 
 
404 aa  71.6  2e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  27.07 
 
 
366 aa  71.2  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.03 
 
 
349 aa  70.5  5e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.43 
 
 
374 aa  68.9  1e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  40 
 
 
415 aa  68.9  2e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.61 
 
 
360 aa  67.4  4e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0151  YeeE/YedE family integral membrane protein  23 
 
 
418 aa  66.6  7e-10  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.40844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.04 
 
 
471 aa  66.2  8e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.04 
 
 
371 aa  66.2  9e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  25.27 
 
 
420 aa  65.1  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.59 
 
 
368 aa  64.7  3e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.45 
 
 
351 aa  64.7  3e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  44.83 
 
 
175 aa  64.3  3e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0951  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.79 
 
 
415 aa  63.5  5e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
173 aa  63.2  7e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.61 
 
 
416 aa  61.6  2e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.75 
 
 
345 aa  62  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.52 
 
 
373 aa  62  2e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.95 
 
 
180 aa  60.5  5e-08  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.89 
 
 
170 aa  59.7  8e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.78 
 
 
174 aa  59.7  8e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.73 
 
 
368 aa  58.9  1e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.73 
 
 
355 aa  58.5  2e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  34.42 
 
 
455 aa  58.9  2e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1848  putative inner membrane protein  38.38 
 
 
402 aa  57.8  3e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.37 
 
 
404 aa  57.4  4e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.51 
 
 
371 aa  57  5e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.1 
 
 
183 aa  57.4  5e-07  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1673  putative inner membrane protein  38.38 
 
 
402 aa  56.6  7e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1492  putative inner membrane protein  38.38 
 
 
402 aa  56.6  7e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.34 
 
 
371 aa  56.2  8e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.06 
 
 
423 aa  55.1  2e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>