177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  687    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  46.15 
 
 		 338 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  45.87 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  45.87 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  46.99 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  45.2 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  48.08 
 
 		 342 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  45.56 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  47.43 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  46.29 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  43.57 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  39.68 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  38.48 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  40.81 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  37.28 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  35.61 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.4 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  23.51 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  31.43 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  21.83 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.53 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  34.15 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  33.01 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  30.09 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  22.48 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.39 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  33.78 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  29.64 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.67 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 425 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 402 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  30.67 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.01 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.96 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.51 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  21.9 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.65 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  21.71 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.05 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0080  hypothetical protein  26.25 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.27 
 
 		 552 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.3 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  40.74 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  38.16 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  41.67 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  46.43 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  26.74 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  36.57 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  42.37 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.12 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  28.11 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0092  hypothetical protein  25.94 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.33 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.59 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  41.56 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  31.32 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.99 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  26.35 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  26.79 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  31.34 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  32 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4971  monooxygenase FAD-binding  28.96 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415719  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  19.74 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.05 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.27 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  30.2 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  38.46 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  21.18 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10814  conserved hypothetical protein  37.29 
 
 		 560 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00328838  normal  0.122281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.67 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>