233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00500 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  100 
 
 
373 aa  720  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  58.52 
 
 
364 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  56.25 
 
 
350 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  55.68 
 
 
350 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  55.68 
 
 
350 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  56.06 
 
 
352 aa  335  8e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  53.07 
 
 
360 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  54.95 
 
 
350 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  50.85 
 
 
353 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  50.85 
 
 
357 aa  308  7e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  50.28 
 
 
353 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.41245e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  47.38 
 
 
361 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  51.23 
 
 
366 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  51.42 
 
 
306 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  51.42 
 
 
306 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  48.13 
 
 
357 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  50.71 
 
 
369 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  44.67 
 
 
349 aa  275  1e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  53.96 
 
 
378 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  42.57 
 
 
354 aa  272  8e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  48.77 
 
 
355 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  53.35 
 
 
378 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  49.04 
 
 
359 aa  244  2e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  37.23 
 
 
350 aa  218  9e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  39.73 
 
 
355 aa  218  9e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  37.57 
 
 
350 aa  214  2e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.5 
 
 
350 aa  214  2e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  46.15 
 
 
370 aa  213  6e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  40.38 
 
 
350 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.03 
 
 
354 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  34.38 
 
 
394 aa  197  2e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.63 
 
 
350 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  42.17 
 
 
378 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  33.16 
 
 
373 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.61 
 
 
350 aa  185  1e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  37.5 
 
 
349 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  37.5 
 
 
349 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.43 
 
 
350 aa  180  3e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.79 
 
 
350 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.34 
 
 
352 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  30.21 
 
 
359 aa  172  8e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  35.67 
 
 
347 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.95 
 
 
373 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.27 
 
 
393 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  35.22 
 
 
351 aa  129  7e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.33 
 
 
344 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  30.53 
 
 
393 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  24.25 
 
 
362 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  24.25 
 
 
362 aa  123  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  31.02 
 
 
382 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.46 
 
 
377 aa  121  2e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.37 
 
 
404 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.64 
 
 
368 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  31.62 
 
 
413 aa  115  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  31.34 
 
 
343 aa  114  4e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  33.58 
 
 
361 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  29.46 
 
 
364 aa  111  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  31.42 
 
 
366 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  29.07 
 
 
363 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  27.3 
 
 
357 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  31.53 
 
 
349 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.49 
 
 
363 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.53 
 
 
365 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  27.37 
 
 
404 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  26.14 
 
 
362 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  30.16 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  27.8 
 
 
360 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.93 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  29.14 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53142e-08 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  25.33 
 
 
656 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.49 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.31 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.19 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  27.93 
 
 
406 aa  85.5  1e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.55 
 
 
406 aa  82.4  1e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.99 
 
 
349 aa  77.8  3e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.05 
 
 
376 aa  70.1  6e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.5 
 
 
319 aa  67  5e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2923  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.35 
 
 
325 aa  64.7  2e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437795  hitchhiker  0.000795877 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5526  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.18 
 
 
332 aa  63.2  7e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.386832  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.15 
 
 
332 aa  63.2  7e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0602  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.83 
 
 
319 aa  62.8  8e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.74189e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  24.91 
 
 
409 aa  62.8  1e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6224  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.19 
 
 
330 aa  60.5  4e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379865  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2934  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.19 
 
 
326 aa  60.5  5e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2750  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  27.33 
 
 
326 aa  59.7  8e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2842  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.33 
 
 
326 aa  59.7  8e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3101  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.9 
 
 
330 aa  59.3  9e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148941 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1492  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.28 
 
 
333 aa  59.7  9e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.560119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1613  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.32 
 
 
328 aa  59.7  9e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.8 
 
 
330 aa  58.9  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.47729e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.11 
 
 
334 aa  59.3  1e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0986  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.18 
 
 
334 aa  58.2  2e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0821  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.53 
 
 
325 aa  58.5  2e-07  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0516766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.87 
 
 
328 aa  57.4  5e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.524505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1215  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  20.82 
 
 
351 aa  56.6  7e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2676  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.85 
 
 
325 aa  56.6  7e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00217657  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  22.58 
 
 
330 aa  55.8  1e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  23.96 
 
 
545 aa  55.8  1e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2686  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.44 
 
 
325 aa  54.7  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>