16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00490 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  45.74 
 
 
291 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  40.76 
 
 
282 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  42.99 
 
 
271 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  38.71 
 
 
290 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  43.18 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  37.18 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  48.39 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  42.6 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  44.37 
 
 
303 aa  80.5  3e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  42.26 
 
 
310 aa  73.9  2e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  42.66 
 
 
282 aa  73.2  5e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  34.21 
 
 
290 aa  53.5  3e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  39.15 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01780  prenyltransferase, putative  32.88 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.54 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>