109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00460 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  100 
 
 
565 aa  1102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  60.85 
 
 
198 aa  273  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  70.75 
 
 
169 aa  216  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02390  hypothetical protein  54.92 
 
 
273 aa  166  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  41.35 
 
 
748 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  44.19 
 
 
637 aa  96.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  41.78 
 
 
593 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  41.96 
 
 
601 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  39.08 
 
 
532 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  41.96 
 
 
586 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  36.96 
 
 
426 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  50.54 
 
 
601 aa  87  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  50.54 
 
 
571 aa  86.3  1e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  39.16 
 
 
484 aa  86.3  2e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  40.56 
 
 
582 aa  85.9  2e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  39.16 
 
 
567 aa  85.9  2e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  46.24 
 
 
519 aa  84.7  4e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  46.39 
 
 
550 aa  83.2  1e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4137e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  48.31 
 
 
441 aa  83.2  1e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  34.78 
 
 
567 aa  83.2  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  48.39 
 
 
516 aa  82  3e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  48.39 
 
 
491 aa  81.6  3e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  47.31 
 
 
508 aa  81.6  3e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  47.31 
 
 
508 aa  81.6  3e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  48.39 
 
 
491 aa  81.6  4e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  48.39 
 
 
491 aa  81.6  4e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  48.39 
 
 
514 aa  81.6  4e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  47.87 
 
 
508 aa  81.3  4e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  47.87 
 
 
508 aa  81.3  4e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  47.19 
 
 
512 aa  80.1  9e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  34.78 
 
 
443 aa  79.3  1e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  34.06 
 
 
443 aa  77.4  6e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  46.07 
 
 
539 aa  77.4  6e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  43.48 
 
 
480 aa  76.3  1e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  44.79 
 
 
581 aa  76.3  1e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  44.79 
 
 
581 aa  76.3  1e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  43.48 
 
 
480 aa  76.3  2e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  43.48 
 
 
480 aa  76.3  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  44.79 
 
 
578 aa  75.9  2e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  40.86 
 
 
535 aa  74.3  5e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  43.43 
 
 
578 aa  74.3  5e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  43.75 
 
 
593 aa  73.9  8e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  41.57 
 
 
488 aa  73.9  8e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  43.75 
 
 
593 aa  73.9  8e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  41.57 
 
 
511 aa  73.6  9e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  38.17 
 
 
620 aa  73.6  9e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  32.64 
 
 
628 aa  73.2  1e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  42.71 
 
 
578 aa  71.6  3e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  42.71 
 
 
578 aa  71.6  3e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  34.71 
 
 
709 aa  69.3  2e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  28.14 
 
 
510 aa  68.9  2e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  33.09 
 
 
530 aa  68.9  2e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  40.86 
 
 
524 aa  68.6  3e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  39.29 
 
 
516 aa  68.2  4e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  36.04 
 
 
714 aa  67.8  5e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  40 
 
 
550 aa  67.8  6e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  42.86 
 
 
506 aa  67.4  7e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  35.45 
 
 
603 aa  66.6  1e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  4.98536e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  39.78 
 
 
519 aa  67  1e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  38.71 
 
 
517 aa  65.5  3e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  38.71 
 
 
516 aa  64.7  4e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  34.81 
 
 
743 aa  63.9  7e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  33.94 
 
 
551 aa  61.6  3e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  40 
 
 
535 aa  61.6  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  41.84 
 
 
310 aa  62  3e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  33.73 
 
 
473 aa  60.8  6e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  34.43 
 
 
579 aa  60.1  1e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  35.48 
 
 
523 aa  58.5  3e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  42.22 
 
 
498 aa  58.2  4e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  35.42 
 
 
572 aa  57.4  7e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  34.38 
 
 
557 aa  56.2  2e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  32.79 
 
 
519 aa  55.8  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  34.38 
 
 
602 aa  55.8  2e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  31.52 
 
 
464 aa  55.5  3e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  31.5 
 
 
602 aa  54.3  5e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  30.43 
 
 
605 aa  54.7  5e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  40.79 
 
 
620 aa  53.9  7e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  35.42 
 
 
566 aa  54.3  7e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  31.36 
 
 
499 aa  53.1  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  34.55 
 
 
586 aa  52.8  2e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  35.64 
 
 
479 aa  52.4  2e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  34.55 
 
 
546 aa  52.4  2e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  33.03 
 
 
512 aa  52  3e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  33.64 
 
 
554 aa  52  3e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  27.01 
 
 
556 aa  51.6  4e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  32.61 
 
 
553 aa  51.2  5e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  35.78 
 
 
561 aa  51.2  5e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  30.43 
 
 
580 aa  50.8  7e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.57 
 
 
580 aa  50.4  8e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  30.43 
 
 
584 aa  50.4  9e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  30.28 
 
 
558 aa  50.4  9e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  25.23 
 
 
620 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94245e-10 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  26.17 
 
 
568 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  34.23 
 
 
577 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  25.23 
 
 
566 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  31.73 
 
 
535 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  34.09 
 
 
589 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  34.78 
 
 
494 aa  47.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  37.93 
 
 
521 aa  47.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  24.3 
 
 
585 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>