34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  100 
 
 
426 aa  816  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  62.24 
 
 
427 aa  490  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  68.2 
 
 
414 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  62.34 
 
 
412 aa  451  1e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  55.77 
 
 
416 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  50.35 
 
 
425 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  53.09 
 
 
410 aa  401  1e-110  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  53.59 
 
 
410 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  51.77 
 
 
411 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  53.46 
 
 
421 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  48.25 
 
 
395 aa  356  4e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  47.3 
 
 
413 aa  343  3e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  44.56 
 
 
395 aa  341  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  49.49 
 
 
406 aa  335  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  44.84 
 
 
409 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  44.84 
 
 
409 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  44.67 
 
 
394 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  45.3 
 
 
414 aa  313  3e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  47.77 
 
 
386 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  43.67 
 
 
408 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  41.29 
 
 
410 aa  290  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  39.05 
 
 
412 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  40.32 
 
 
412 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.89 
 
 
416 aa  60.5  5e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.05 
 
 
401 aa  59.3  1e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  22.14 
 
 
439 aa  56.2  1e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.92 
 
 
429 aa  54.3  4e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  24.86 
 
 
398 aa  51.6  3e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.33 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.96 
 
 
403 aa  47.4  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  28.38 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  21.92 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  22 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  21.97 
 
 
427 aa  43.5  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>