15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00360  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 
143 aa  286  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2927  pyrimidine dimer DNA glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.22 
 
 
147 aa  148  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158188  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0704  hypothetical protein  53.19 
 
 
158 aa  146  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15080  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.02 
 
 
162 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3486  hypothetical protein  55.17 
 
 
153 aa  140  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11900  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.65 
 
 
154 aa  139  2e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.97418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0386  hypothetical protein  43.66 
 
 
142 aa  132  2e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1205  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / pyrimidine dimer DNA glycosylase  51.41 
 
 
142 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1470  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.65 
 
 
142 aa  130  8e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2949  hypothetical protein  47.18 
 
 
155 aa  127  5e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.134771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1958  hypothetical protein  43.66 
 
 
149 aa  125  2e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0746675  hitchhiker  0.00408107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1486  hypothetical protein  40.62 
 
 
129 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0511385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1440  hypothetical protein  40.62 
 
 
129 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.75947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0788  50S ribosomal protein L23  35.42 
 
 
148 aa  100  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0336  hypothetical protein  33.77 
 
 
114 aa  75.5  2e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.072829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>