More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00340  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  100 
 
 
403 aa  823  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.349198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17150  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  65.1 
 
 
415 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554879  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.27 
 
 
393 aa  516  1e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.85596e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5415  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.03 
 
 
393 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3437  alcohol dehydrogenase  63.28 
 
 
391 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5109  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  60.55 
 
 
392 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5197  alcohol dehydrogenase  60.55 
 
 
392 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5488  alcohol dehydrogenase  60.55 
 
 
392 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4749  alcohol dehydrogenase  59.8 
 
 
393 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1966  alcohol dehydrogenase  59.55 
 
 
393 aa  494  1e-138  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0317258  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  60.79 
 
 
393 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0818  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.46 
 
 
401 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1926  alcohol dehydrogenase  59.31 
 
 
393 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0344  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.33 
 
 
396 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19850  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  60.3 
 
 
400 aa  473  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.809397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6610  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.06 
 
 
394 aa  467  1e-130  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.965415  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.82 
 
 
392 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12950  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  59.55 
 
 
394 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1803  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.82 
 
 
392 aa  453  1e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0885  putative glutathione-dependent aldehyde dehydrogenase  54.84 
 
 
391 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.418745  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16630  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  59.06 
 
 
358 aa  447  1e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0720  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  54.72 
 
 
389 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00145968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1589  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.34 
 
 
394 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0618655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2778  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  56.58 
 
 
392 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.59 
 
 
393 aa  417  1e-115  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0573  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.72 
 
 
389 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4500  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.04 
 
 
392 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.658078  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.87 
 
 
388 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2429  alcohol dehydrogenase  47.7 
 
 
400 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0410446  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3663  hypothetical protein  46.62 
 
 
394 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184617  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3104  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  47.1 
 
 
394 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.345929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3833  alcohol dehydrogenase  47.1 
 
 
394 aa  338  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24597  normal  0.375314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2370  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.77 
 
 
389 aa  338  1e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5446  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.52 
 
 
392 aa  337  2e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.715601  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3187  alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
389 aa  337  3e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5159  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.69 
 
 
390 aa  336  3e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150662  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0166  putative glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
395 aa  336  4e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912922  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2860  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.41 
 
 
389 aa  336  4e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.489026  normal  0.707248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4725  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.71 
 
 
391 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1223  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.01 
 
 
390 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2264  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.63 
 
 
390 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2307  alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 
390 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0161452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0531  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.39 
 
 
390 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2984  alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 
400 aa  332  7e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.29856  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5561  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.28 
 
 
389 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210102  normal  0.0249106 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5345  alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 
399 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.501465  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.63 
 
 
390 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4801  alcohol dehydrogenase  45.26 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0751128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4105  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.66 
 
 
390 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5822  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.61 
 
 
391 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3970  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.25 
 
 
400 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0110  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 
390 aa  328  1e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2149  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.01 
 
 
386 aa  328  1e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.406335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3527  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.75 
 
 
411 aa  327  2e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129082  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3683  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.66 
 
 
397 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4494  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
390 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134818  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6253  alcohol dehydrogenase  44.15 
 
 
391 aa  325  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.731237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0065  alcohol dehydrogenase  44.28 
 
 
386 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.130136  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0122  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.26 
 
 
401 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.566245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0139  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.01 
 
 
401 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2481  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.69 
 
 
387 aa  322  1e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1875  glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase  46 
 
 
411 aa  321  1e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2641  alcohol dehydrogenase  46.25 
 
 
396 aa  321  2e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246923  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.45 
 
 
391 aa  318  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  0.119261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.99 
 
 
398 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.609837  decreased coverage  0.000185041 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4057  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
433 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.788461  normal  0.848638 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0165  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.13 
 
 
389 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2247  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  43.17 
 
 
391 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644611  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2482  putative zinc-containing dehydrogenase  42.37 
 
 
389 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0322  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.63 
 
 
387 aa  313  3e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1441  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.69 
 
 
390 aa  313  4e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.42991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4498  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.72 
 
 
389 aa  312  5e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3112  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.42 
 
 
388 aa  312  6e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.152698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0575  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.31 
 
 
389 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0041  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.45 
 
 
405 aa  310  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4200  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.66 
 
 
385 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00566  hypothetical protein  43.86 
 
 
412 aa  309  6e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00577  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  43.86 
 
 
412 aa  309  6e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0695  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.86 
 
 
412 aa  309  7e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3035  alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
412 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3016  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.61 
 
 
412 aa  308  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0660  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.61 
 
 
412 aa  308  1e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1246  zinc-type alcohol dehydrogenase  42.72 
 
 
385 aa  308  1e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.939827  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.83 
 
 
385 aa  307  2e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  hitchhiker  0.00205277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0669  alcohol dehydrogenase GroES-like domain protein  44.17 
 
 
412 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432264  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0728  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  44.17 
 
 
412 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0655  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  44.17 
 
 
412 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4691  alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 
389 aa  306  4e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0774  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase (glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase) (fdh) (faldh)  44.17 
 
 
412 aa  306  4e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0160  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.72 
 
 
392 aa  305  1e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0630  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  43.37 
 
 
412 aa  304  2e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.27 
 
 
393 aa  304  2e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0714  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  43.93 
 
 
412 aa  303  3e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3881  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
391 aa  302  5e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0212673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2300  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
388 aa  303  5e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  hitchhiker  7.77829e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4212  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.57 
 
 
376 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.50849e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.41 
 
 
390 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.430041  normal  0.349478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1619  alcohol dehydrogenase  44.31 
 
 
384 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.682346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1016  alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
390 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.05 
 
 
384 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>