197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00310 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  100 
 
 
645 aa  1281    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  43.75 
 
 
608 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  39.9 
 
 
601 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  39.47 
 
 
624 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  32.09 
 
 
624 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  36.99 
 
 
620 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  41.12 
 
 
483 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  35.64 
 
 
613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  42.52 
 
 
425 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  39.95 
 
 
418 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  45.12 
 
 
334 aa  290  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  40.89 
 
 
422 aa  289  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  43.43 
 
 
343 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  45.48 
 
 
318 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  43.25 
 
 
343 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  44.41 
 
 
331 aa  277  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  42.38 
 
 
343 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  45.18 
 
 
456 aa  272  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  39.46 
 
 
412 aa  269  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  38.15 
 
 
305 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  38.15 
 
 
305 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  39.94 
 
 
347 aa  217  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  40.19 
 
 
306 aa  217  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  37.39 
 
 
332 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  36.59 
 
 
311 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  36.45 
 
 
313 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04560  glutaminase  30.4 
 
 
615 aa  207  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  40.26 
 
 
311 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  37.72 
 
 
333 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  40.58 
 
 
311 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  41.69 
 
 
311 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  38.44 
 
 
304 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  37.93 
 
 
306 aa  203  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  40.19 
 
 
346 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  36.53 
 
 
338 aa  200  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  34.56 
 
 
330 aa  199  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  37.5 
 
 
304 aa  199  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  37.5 
 
 
304 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  37.5 
 
 
304 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  38.85 
 
 
304 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  40.53 
 
 
309 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  35.17 
 
 
310 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  40.53 
 
 
309 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  35.47 
 
 
310 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  35.17 
 
 
310 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  39.1 
 
 
304 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  37.19 
 
 
304 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  37.65 
 
 
304 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  39.1 
 
 
304 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  35.17 
 
 
310 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  35.17 
 
 
310 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  40.39 
 
 
304 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  39.6 
 
 
304 aa  195  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  35.17 
 
 
310 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  36.88 
 
 
304 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  38.41 
 
 
306 aa  194  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  35.17 
 
 
310 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  39.1 
 
 
304 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  39.1 
 
 
304 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  39.1 
 
 
304 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  39.1 
 
 
304 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  39 
 
 
315 aa  194  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  33.96 
 
 
307 aa  193  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  34.86 
 
 
310 aa  193  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  34.86 
 
 
310 aa  193  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  38.22 
 
 
309 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  38.81 
 
 
317 aa  192  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  39.53 
 
 
309 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  40 
 
 
308 aa  191  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  39.25 
 
 
331 aa  191  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  38.67 
 
 
309 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  36.34 
 
 
434 aa  190  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  38.46 
 
 
308 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  36.16 
 
 
306 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  35.43 
 
 
306 aa  188  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09673  glutaminase  35.43 
 
 
304 aa  187  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  34.25 
 
 
316 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1222  glutaminase  35.62 
 
 
304 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0064518  normal  0.448256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  37.66 
 
 
309 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  34.56 
 
 
331 aa  187  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  34.43 
 
 
309 aa  187  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  37.34 
 
 
309 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  36.42 
 
 
306 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2488  glutaminase, putative  36.22 
 
 
302 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.347136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1126  glutaminase  35.62 
 
 
304 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0389369  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  35.51 
 
 
306 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  32.51 
 
 
326 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  35.62 
 
 
304 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  32.2 
 
 
326 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  32.2 
 
 
326 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  36.98 
 
 
309 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  32.2 
 
 
326 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  38.67 
 
 
318 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  32.2 
 
 
326 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1741  L-glutaminase  36.88 
 
 
304 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  32.2 
 
 
326 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  37.25 
 
 
309 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  40.92 
 
 
316 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  32.81 
 
 
335 aa  184  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  32.49 
 
 
326 aa  184  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>