34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00290 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00290  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  358  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  53.42 
 
 
150 aa  165  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01871  lipoprotein, putative  51.7 
 
 
223 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5023  hypothetical protein  47.33 
 
 
160 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5965  hypothetical protein  46.2 
 
 
160 aa  150  9e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68970  hypothetical protein  47.26 
 
 
160 aa  146  1e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5432  hypothetical protein  43.92 
 
 
161 aa  145  4e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5198  hypothetical protein  44.83 
 
 
160 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5258  hypothetical protein  44.83 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5105  hypothetical protein  44.83 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0979763  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2166  hypothetical protein  44.3 
 
 
184 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  41.38 
 
 
164 aa  133  1e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0834  hypothetical protein  40.97 
 
 
154 aa  127  1e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0956  hypothetical protein  42.25 
 
 
141 aa  126  1e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  45.45 
 
 
162 aa  126  2e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1689  hypothetical protein  40.28 
 
 
166 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.92743e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01340  hypothetical protein  38.46 
 
 
167 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1255  hypothetical protein  41.55 
 
 
179 aa  120  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.641108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004125  hypothetical protein  38.46 
 
 
167 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.93845e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  37.59 
 
 
176 aa  116  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2058  hypothetical protein  41.5 
 
 
165 aa  115  2e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3579  hypothetical protein  41.67 
 
 
163 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0975  hypothetical protein  41.96 
 
 
157 aa  113  1e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.149641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3511  hypothetical protein  41.61 
 
 
163 aa  109  2e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0513  hypothetical protein  35.88 
 
 
172 aa  108  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00777462  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1465  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1802  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2318  hypothetical protein  33.8 
 
 
185 aa  104  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45413  predicted protein  36.67 
 
 
175 aa  101  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000791095  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2015  hypothetical protein  33.8 
 
 
185 aa  100  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179761  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2397  hypothetical protein  32.65 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1551  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.47627e-05  hitchhiker  0.00645173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2158  translation elongation factor P (EF-P)  27.78 
 
 
161 aa  83.2  2e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401757  normal  0.635134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  23.13 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>