More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  100 
 
 
342 aa  690  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  67.62 
 
 
315 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  65.08 
 
 
324 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  64.24 
 
 
331 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  2.48585e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  63.32 
 
 
328 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  63.32 
 
 
328 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  63.32 
 
 
328 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  61.65 
 
 
346 aa  405  1e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  63.17 
 
 
324 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  62.42 
 
 
323 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  61.39 
 
 
322 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  61.71 
 
 
322 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  60.31 
 
 
328 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  58.39 
 
 
337 aa  362  5e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  54.11 
 
 
320 aa  352  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  52.58 
 
 
318 aa  312  6e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  43.64 
 
 
290 aa  232  7e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  41.72 
 
 
337 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  43.99 
 
 
290 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 
290 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  43.58 
 
 
292 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  42.96 
 
 
290 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  43 
 
 
290 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  43 
 
 
290 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  43 
 
 
290 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  43 
 
 
290 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  43 
 
 
290 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  43 
 
 
290 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  43.69 
 
 
290 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  43.34 
 
 
290 aa  220  2e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  43.34 
 
 
290 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  43.34 
 
 
290 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  42.91 
 
 
292 aa  218  8e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  42.18 
 
 
288 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  42.18 
 
 
288 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  42.18 
 
 
288 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  42.32 
 
 
286 aa  215  1e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  42.81 
 
 
288 aa  214  2e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  41.5 
 
 
288 aa  213  5e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  41.5 
 
 
288 aa  212  6e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  41.89 
 
 
290 aa  212  8e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  41.16 
 
 
288 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  41.67 
 
 
293 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  40.14 
 
 
287 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  38.83 
 
 
292 aa  198  1e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  40.2 
 
 
288 aa  195  8e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  40.48 
 
 
288 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  41.46 
 
 
290 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  38.91 
 
 
293 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  39.8 
 
 
288 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.04 
 
 
288 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  39.49 
 
 
286 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  38.44 
 
 
288 aa  190  3e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  38.44 
 
 
288 aa  190  3e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  38.44 
 
 
288 aa  190  3e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  38.44 
 
 
288 aa  190  3e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  38.44 
 
 
288 aa  190  3e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  38.44 
 
 
288 aa  190  3e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  38.44 
 
 
288 aa  190  3e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  38.66 
 
 
303 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  39.49 
 
 
286 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.38 
 
 
293 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  38.57 
 
 
289 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  38.57 
 
 
289 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  41.22 
 
 
287 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  38.57 
 
 
289 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  37.8 
 
 
295 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  40.14 
 
 
293 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  37.11 
 
 
295 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  38.51 
 
 
286 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  38.18 
 
 
286 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  39 
 
 
301 aa  185  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  38.18 
 
 
286 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  38.18 
 
 
286 aa  185  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  38.18 
 
 
286 aa  185  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  42.71 
 
 
283 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  39.49 
 
 
286 aa  182  5e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  35.74 
 
 
295 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  38.93 
 
 
305 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  34.58 
 
 
293 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  38.98 
 
 
288 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  35.35 
 
 
291 aa  180  3e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  37.26 
 
 
303 aa  179  6e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  39.31 
 
 
285 aa  179  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  38.21 
 
 
288 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  34.71 
 
 
293 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  39.39 
 
 
286 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  35.45 
 
 
289 aa  176  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  38.31 
 
 
286 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  39.73 
 
 
286 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  39.64 
 
 
303 aa  174  1e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  39.66 
 
 
286 aa  174  1e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  35.46 
 
 
301 aa  175  1e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  36.33 
 
 
277 aa  174  2e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  42.31 
 
 
283 aa  174  3e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  35.79 
 
 
284 aa  173  4e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  36.3 
 
 
290 aa  172  7e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  36.59 
 
 
288 aa  172  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  38.1 
 
 
274 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>