50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00260  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  460  1e-128  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22720  hypothetical protein  41.08 
 
 
243 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1329  hypothetical protein  40.24 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.385927  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3306  hypothetical protein  40 
 
 
227 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4177  hypothetical protein  38.55 
 
 
225 aa  83.2  3e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32420  hypothetical protein  40.1 
 
 
221 aa  83.2  4e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22140  hypothetical protein  33.01 
 
 
259 aa  77.8  1e-13  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0105  hypothetical protein  36.2 
 
 
221 aa  75.1  1e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136053  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  70.1  3e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194441  normal  0.436437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2783  hypothetical protein  31.28 
 
 
211 aa  64.7  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0781526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4194  hypothetical protein  28.96 
 
 
219 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4273  hypothetical protein  29.03 
 
 
211 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1448  hypothetical protein  29.03 
 
 
211 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.601654  normal  0.316889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3297  hypothetical protein  27.03 
 
 
220 aa  62.8  5e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1085  hypothetical protein  30.2 
 
 
226 aa  61.6  1e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2530  integral membrane protein  31.55 
 
 
207 aa  59.7  4e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000539484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2555  hypothetical protein  32.74 
 
 
211 aa  59.7  4e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2804  integral membrane protein  30.95 
 
 
207 aa  58.9  7e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2748  hypothetical protein  33.71 
 
 
213 aa  58.2  1e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2762  integral membrane protein  30.95 
 
 
207 aa  56.6  3e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.342781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2177  hypothetical protein  35.11 
 
 
212 aa  56.2  4e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359775  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5984  hypothetical protein  29.38 
 
 
227 aa  56.2  5e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0526  hypothetical protein  30.82 
 
 
205 aa  55.8  5e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3616  hypothetical protein  35.88 
 
 
236 aa  55.5  7e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4455  hypothetical protein  35.88 
 
 
236 aa  55.5  7e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3911  hypothetical protein  35.88 
 
 
236 aa  55.5  7e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4574  hypothetical protein  29.09 
 
 
212 aa  55.5  8e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2511  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2372  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0473  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.690189  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0824  integral membrane protein  30.59 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.701818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02190  hypothetical protein  34.15 
 
 
230 aa  55.1  1e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0424  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1802  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4357  hypothetical protein  27.44 
 
 
211 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3928  hypothetical protein  26.64 
 
 
219 aa  53.5  3e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.811707  normal  0.0524532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0635  hypothetical protein  29.31 
 
 
211 aa  53.1  4e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0911562  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3289  hypothetical protein  35.11 
 
 
236 aa  53.1  4e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356174  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3805  hypothetical protein  37.31 
 
 
212 aa  52.8  5e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404034  normal  0.773364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2485  hypothetical protein  25.14 
 
 
207 aa  52.8  5e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0511  hypothetical protein  31.71 
 
 
217 aa  52.8  5e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0555837  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2278  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  50.8  2e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  0.0474109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4672  hypothetical protein  34.35 
 
 
212 aa  50.4  3e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.178311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2553  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  50.1  3e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.284006  normal  0.21762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2191  hypothetical protein  29.84 
 
 
236 aa  50.1  3e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3812  hypothetical protein  30.41 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2219  hypothetical protein  30.11 
 
 
173 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233822  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2236  hypothetical protein  30.88 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.112154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3191  hypothetical protein  32.09 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0275  hypothetical protein  26.88 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>