More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 
490 aa  979  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  53.47 
 
 
483 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.7 
 
 
493 aa  441  1e-122  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  49.7 
 
 
489 aa  441  1e-122  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  46.44 
 
 
485 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  47.05 
 
 
481 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.46 
 
 
489 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  48.26 
 
 
482 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.58 
 
 
485 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.26 
 
 
480 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.06 
 
 
483 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  45.62 
 
 
480 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.91 
 
 
488 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.55 
 
 
485 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 
491 aa  357  3e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 
491 aa  357  3e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 
491 aa  357  3e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  42.23 
 
 
504 aa  357  4e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.56 
 
 
487 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  42.2 
 
 
488 aa  353  3e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  40.96 
 
 
485 aa  353  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.09 
 
 
491 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.45 
 
 
490 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.96 
 
 
486 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  41.41 
 
 
489 aa  340  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.16 
 
 
481 aa  338  9e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  42.25 
 
 
482 aa  338  9e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 
493 aa  338  1e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  42 
 
 
484 aa  338  2e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  41.26 
 
 
491 aa  336  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  42.34 
 
 
491 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  39.2 
 
 
495 aa  327  4e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  39.2 
 
 
488 aa  319  8e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 
486 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.81199e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  39.8 
 
 
501 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 
503 aa  304  2e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.55 
 
 
490 aa  303  4e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  39.3 
 
 
489 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  37.55 
 
 
492 aa  283  7e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 
458 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  40.49 
 
 
504 aa  279  9e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
473 aa  263  7e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.93 
 
 
476 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 
478 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.81 
 
 
493 aa  259  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
470 aa  249  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.01617e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 
924 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 
503 aa  240  3e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  33.07 
 
 
487 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 
461 aa  240  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  33.07 
 
 
487 aa  239  6e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  35.34 
 
 
933 aa  239  6e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.47 
 
 
472 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  30.63 
 
 
972 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  31.38 
 
 
471 aa  222  1e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  33.06 
 
 
921 aa  219  9e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  37.2 
 
 
578 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 
577 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
574 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 
547 aa  210  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  36.56 
 
 
640 aa  203  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
954 aa  203  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.41 
 
 
610 aa  202  1e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 
573 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 
723 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 
586 aa  197  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
570 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
584 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  34.52 
 
 
579 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.48 
 
 
639 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
609 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 
643 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  36.53 
 
 
615 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  32.88 
 
 
646 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 
600 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 
701 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
611 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.18 
 
 
705 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
678 aa  177  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 
636 aa  176  1e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  35.44 
 
 
646 aa  175  2e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.74 
 
 
629 aa  175  2e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.65 
 
 
647 aa  174  3e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
662 aa  174  3e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 
664 aa  174  4e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.16 
 
 
596 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 
602 aa  173  6e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 
602 aa  173  6e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 
645 aa  173  6e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 
642 aa  173  6e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 
610 aa  173  8e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 
613 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.74 
 
 
645 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31 
 
 
711 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  34.09 
 
 
644 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.79 
 
 
631 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.69 
 
 
641 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
647 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
704 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.26 
 
 
626 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>