77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00170 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  459  1e-128  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  44.64 
 
 
263 aa  178  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  47.37 
 
 
255 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  47.79 
 
 
249 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  42.54 
 
 
252 aa  172  4e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  42.31 
 
 
242 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  42.92 
 
 
309 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  42.22 
 
 
253 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  43.53 
 
 
267 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  43.46 
 
 
250 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  42.79 
 
 
272 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  44.5 
 
 
278 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  44.5 
 
 
278 aa  153  3e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  44.5 
 
 
278 aa  153  3e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  40.66 
 
 
270 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  41.7 
 
 
257 aa  147  2e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  44.86 
 
 
243 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  36.4 
 
 
253 aa  133  2e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  40.54 
 
 
280 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  49.36 
 
 
296 aa  131  1e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  45.14 
 
 
329 aa  130  2e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  34.91 
 
 
251 aa  125  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  35.54 
 
 
266 aa  124  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  36.02 
 
 
273 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  38.6 
 
 
262 aa  120  1e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  29.9 
 
 
245 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  29.15 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  44.12 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  33.13 
 
 
301 aa  85.1  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  26.13 
 
 
247 aa  84.7  1e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  79.7  4e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  33.82 
 
 
316 aa  79.7  4e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  29.28 
 
 
292 aa  79.3  5e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  35.66 
 
 
290 aa  76.6  3e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  32.21 
 
 
236 aa  76.3  3e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  41.35 
 
 
306 aa  75.5  6e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  25.76 
 
 
239 aa  75.9  6e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  38.35 
 
 
215 aa  74.3  1e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  33.8 
 
 
288 aa  74.3  2e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  29.96 
 
 
234 aa  73.2  3e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  42.71 
 
 
243 aa  72.8  5e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  29.86 
 
 
234 aa  71.2  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  70.5  2e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  38.46 
 
 
238 aa  70.5  2e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  34.07 
 
 
233 aa  69.7  3e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  27.87 
 
 
286 aa  70.1  3e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  26.03 
 
 
243 aa  69.3  5e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  26.8 
 
 
286 aa  67.8  1e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  30.61 
 
 
243 aa  66.6  3e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  30.99 
 
 
243 aa  65.9  5e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  30.48 
 
 
230 aa  65.5  6e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  30.73 
 
 
309 aa  65.5  7e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  38.68 
 
 
273 aa  64.7  1e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  34.9 
 
 
234 aa  63.2  4e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  35.51 
 
 
306 aa  62.4  5e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  31.06 
 
 
304 aa  62.4  6e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  31.06 
 
 
304 aa  62.4  6e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  31.06 
 
 
304 aa  62.4  6e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  30.21 
 
 
234 aa  61.6  1e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  36 
 
 
299 aa  61.2  1e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  26.47 
 
 
233 aa  61.2  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  28.4 
 
 
349 aa  60.8  2e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  25.84 
 
 
237 aa  60.1  3e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  28.67 
 
 
307 aa  59.3  5e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  26.53 
 
 
235 aa  59.3  5e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.89323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  39.45 
 
 
290 aa  55.8  6e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  27.27 
 
 
246 aa  55.5  7e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  30.17 
 
 
296 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  25.88 
 
 
234 aa  53.5  3e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  29.13 
 
 
297 aa  53.1  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  34.83 
 
 
276 aa  50.4  2e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  30.81 
 
 
300 aa  50.8  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  31.06 
 
 
297 aa  49.3  5e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  30.28 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.40335e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  26.42 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  26.17 
 
 
325 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  28.21 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>