26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  175  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  72.4  2e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  43.1 
 
 
83 aa  71.6  3e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13441e-11 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  38.55 
 
 
81 aa  68.6  2e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  36.78 
 
 
94 aa  64.7  4e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  47.46 
 
 
110 aa  64.7  5e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  41.18 
 
 
87 aa  62.4  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  40.54 
 
 
101 aa  61.6  4e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  35 
 
 
89 aa  60.8  5e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  35.87 
 
 
158 aa  60.1  9e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  1.80482e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  59.7  1e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  35.44 
 
 
84 aa  59.7  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  35.63 
 
 
87 aa  57  8e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  37.65 
 
 
101 aa  55.8  2e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  34.88 
 
 
90 aa  54.7  4e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  30.86 
 
 
81 aa  53.9  7e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  31.71 
 
 
81 aa  53.1  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  29.11 
 
 
84 aa  52.8  2e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  31.76 
 
 
85 aa  50.4  8e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  33.75 
 
 
124 aa  49.3  2e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  41.38 
 
 
83 aa  48.5  3e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  40.32 
 
 
85 aa  47.4  7e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  27.27 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  40.74 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  32.56 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  30.67 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>