205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  97.3 
 
 
74 bp  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0001  tRNA-Ile  90 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  90.16 
 
 
74 bp  73.8  5e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  86.49 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  95.24 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  86.49 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0009  tRNA-Ile  85.53 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0002  tRNA-Ile  85.53 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0121  tRNA-Ile  85.53 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0058  tRNA-Ile  85.53 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00305768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  85.53 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  85.53 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0001  tRNA-Ile  88.14 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0001  tRNA-Ile  85.33 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.429514  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0031  tRNA-Ile  92.86 
 
 
77 bp  60  8e-08  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.136071  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1806  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  5.32501e-13 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0054  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.467793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0110  tRNA-Ile  85.14 
 
 
77 bp  60  8e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436648  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1800  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21567e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1603  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.840001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1568  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0001  tRNA-Ile  84.93 
 
 
77 bp  58  3e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  hitchhiker  0.00194035 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0095  tRNA-Ile  86.15 
 
 
74 bp  58  3e-07  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0025  tRNA-Ile  85.51 
 
 
77 bp  58  3e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.04712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0002  tRNA-Ile  85.51 
 
 
77 bp  58  3e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000719363  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0001  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  3e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412787  normal  0.687718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0048  tRNA-Ile  85.94 
 
 
77 bp  56  1e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00260543  hitchhiker  0.000838943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0019  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0039  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0023  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0208908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0001  tRNA-Ile  84.72 
 
 
77 bp  56  1e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334662  normal  0.586783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.03823e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.71401e-07  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  84.21 
 
 
79 bp  56  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.56223e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.21 
 
 
80 bp  56  1e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  84.21 
 
 
77 bp  56  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  9.39428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  7.6362e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  84 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  52  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>