More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4710 on replicon NC_009660
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009660  Krad_4710  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
263 aa  520  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39 
 
 
265 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 
274 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4176  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.84 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4883  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.99 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
269 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.82 
 
 
278 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  36.63 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.75 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  37.55 
 
 
370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.73 
 
 
254 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0348907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.66 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.6 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 
250 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 
255 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.51 
 
 
256 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.44 
 
 
301 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.79 
 
 
315 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  35.51 
 
 
276 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.52 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.5 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
294 aa  119  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  34.11 
 
 
263 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.27 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  34.24 
 
 
347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.19 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.02 
 
 
253 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  34.8 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.33 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  34.8 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.76 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  32.68 
 
 
294 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  34.8 
 
 
333 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  32.8 
 
 
348 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.52 
 
 
253 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  35.15 
 
 
315 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.4 
 
 
258 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.38 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.13 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.52 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.15 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.43 
 
 
336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.9 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.8 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18290  chromosome partitioning ATPase  34.98 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.38 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.38 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1796  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.59 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
265 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 
254 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 
267 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
268 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 
253 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.65 
 
 
256 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5560  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 
256 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.52 
 
 
303 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
265 aa  112  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1545  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.8 
 
 
278 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0482678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.41 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  33.85 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.87 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  32.02 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.4 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.05 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  35.32 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 
433 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.7 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.54 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.8 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.27 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.92 
 
 
339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.78 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.17 
 
 
266 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.34 
 
 
256 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  32.68 
 
 
258 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.07 
 
 
332 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  30.04 
 
 
256 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
305 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  30.04 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>