22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4702 on replicon NC_009660
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009660  Krad_4702  hypothetical protein  100 
 
 		 891 aa  1759    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1426  Bifunctional DNA primase/polymerase  41.62 
 
 		 808 aa  254  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753163  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3516  hypothetical protein  39.67 
 
 		 718 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.487175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3566  hypothetical protein  39.67 
 
 		 717 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748776  normal  0.18845 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3589  hypothetical protein  39.67 
 
 		 718 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.647745  normal  0.116659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  30.47 
 
 		 874 aa  65.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  30.47 
 
 		 874 aa  65.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  32.54 
 
 		 987 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  35.05 
 
 		 820 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  32.85 
 
 		 483 aa  47.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  30.19 
 
 		 235 aa  47.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  32.52 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  28.21 
 
 		 462 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  30.72 
 
 		 455 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  28.72 
 
 		 462 aa  47  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0228  DNA repair protein RadA  35.1 
 
 		 460 aa  45.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.745621 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  28.66 
 
 		 227 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  29.81 
 
 		 457 aa  45.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  29.81 
 
 		 482 aa  44.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  29.81 
 
 		 481 aa  44.3  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24550  DNA repair protein RadA  34.27 
 
 		 461 aa  44.3  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  29.17 
 
 		 235 aa  44.3  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>