73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4622 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4622  cellulase  100 
 
 		 870 aa  1739    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  49.29 
 
 		 459 aa  253  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0234  1, 4-beta cellobiohydrolase  50.35 
 
 		 422 aa  251  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  49.62 
 
 		 446 aa  250  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.18 
 
 		 469 aa  246  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.29 
 
 		 491 aa  233  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3501  cellulase  42.91 
 
 		 346 aa  214  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.724652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1657  glycoside hydrolase family protein  50.18 
 
 		 495 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01440  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  43.46 
 
 		 439 aa  203  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10061  cellulase celA1  43.39 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0549134  normal  0.652249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3907  endoglucanase  43.4 
 
 		 323 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7197  cellulase  42.75 
 
 		 393 aa  177  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5837  cellulase  43.16 
 
 		 341 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1003  cellulase  44.44 
 
 		 330 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6330  Cellulase  41.88 
 
 		 326 aa  164  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4617  cellulase  39.69 
 
 		 341 aa  157  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5301  cellulase  40.27 
 
 		 329 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.104046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5390  cellulase  40.27 
 
 		 329 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.217743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5680  cellulase  40.27 
 
 		 329 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13180  cellobiohydrolase A (1,4-beta-cellobiosidase A)  39.02 
 
 		 359 aa  150  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  36.4 
 
 		 441 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  37.63 
 
 		 456 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.49 
 
 		 437 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1738  glycoside hydrolase family 6  33.43 
 
 		 419 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  39.53 
 
 		 438 aa  134  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  39.02 
 
 		 465 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  38.63 
 
 		 487 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  35.19 
 
 		 448 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2132  Cellulase  35.08 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2131  Cellulase  33.83 
 
 		 350 aa  122  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  30.41 
 
 		 417 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1070  Cellulase  40.08 
 
 		 361 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00218389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3077  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  31.65 
 
 		 487 aa  115  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1687  putative calcium binding protein  27.59 
 
 		 463 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3567  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1798 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.42 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0518  Cellulase  29.93 
 
 		 371 aa  108  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  28.33 
 
 		 621 aa  106  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3602  glycoside hydrolase family 6  33.94 
 
 		 434 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0135  cellulase  28.2 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01273  cellobiohydrolase (nonreducing end) (Eurofung)  28.12 
 
 		 393 aa  97.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05282  Beta-1,4-glucan-cellobiohydrolyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS7]  29.72 
 
 		 450 aa  94.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0190  hypothetical protein  28.8 
 
 		 427 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0236  glycoside hydrolase family 6  33.86 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  26.42 
 
 		 623 aa  78.6  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.89 
 
 		 646 aa  77  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1251  fibronectin, type III domain-containing protein  34.09 
 
 		 497 aa  74.3  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 589 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 1209 aa  70.5  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2947  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.45 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000458427  hitchhiker  0.00017321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  24.25 
 
 		 548 aa  67.4  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  23.64 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.67 
 
 		 633 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918543  normal  0.93944 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.37 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  23.22 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  23.22 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  24.07 
 
 		 605 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  24.86 
 
 		 655 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  24.93 
 
 		 743 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0963  hypothetical protein  24.02 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.82 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  24.59 
 
 		 596 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  25.82 
 
 		 590 aa  57  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 		 1128 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  23.74 
 
 		 611 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  30.37 
 
 		 444 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  25.35 
 
 		 767 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 		 437 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  27.89 
 
 		 444 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  34.04 
 
 		 1276 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  28.47 
 
 		 489 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.4 
 
 		 398 aa  45.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  31.65 
 
 		 437 aa  44.3  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>