128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4567 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 272 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  49.53 
 
 		 197 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  36.55 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  40.94 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  42.02 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  40.28 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  40 
 
 		 519 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  42.73 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  40.88 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.32 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.86 
 
 		 565 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.86 
 
 		 564 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  40.37 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  34.33 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  40.34 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.12 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.12 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  34.57 
 
 		 528 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28.79 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.01 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  32.31 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.24 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.33 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.24 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  29.84 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  28.24 
 
 		 547 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.99 
 
 		 549 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  40.57 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  30.88 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 124 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  26.81 
 
 		 549 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.91 
 
 		 869 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.01 
 
 		 544 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  31.71 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 182 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 		 131 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  31.88 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.66 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  32.06 
 
 		 126 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  31.71 
 
 		 122 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.65 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 139 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  38.79 
 
 		 559 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 193 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  26.52 
 
 		 547 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  34.51 
 
 		 560 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 126 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  27.97 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  37.19 
 
 		 128 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  37.19 
 
 		 128 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.84 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  30.52 
 
 		 697 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  35.24 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.82 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  37.86 
 
 		 578 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  30.88 
 
 		 130 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  32.82 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.91 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 		 126 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  30.95 
 
 		 121 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  30.35 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  29.51 
 
 		 120 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  33.93 
 
 		 124 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 593 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 		 132 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 434 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  32.06 
 
 		 122 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  29.87 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  31.43 
 
 		 144 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 217 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  33.07 
 
 		 120 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  31.21 
 
 		 539 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  33.14 
 
 		 576 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 		 424 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  30.58 
 
 		 513 aa  45.8  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  31.39 
 
 		 203 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  28.46 
 
 		 122 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.01 
 
 		 128 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  29.73 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>