107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4566 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  100 
 
 		 739 aa  1455    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  38.84 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  38.66 
 
 		 718 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  42.18 
 
 		 631 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  39.32 
 
 		 752 aa  438  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  47.21 
 
 		 671 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  40.36 
 
 		 722 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  43.69 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  39.14 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  37.57 
 
 		 651 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  40.45 
 
 		 708 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  37.56 
 
 		 687 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  38.78 
 
 		 678 aa  386  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  44.4 
 
 		 664 aa  369  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  40.6 
 
 		 681 aa  364  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  41.49 
 
 		 711 aa  360  7e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  38.01 
 
 		 687 aa  357  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.79 
 
 		 683 aa  357  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  39.21 
 
 		 665 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  39.21 
 
 		 665 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  39.04 
 
 		 665 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.47 
 
 		 675 aa  355  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  35.91 
 
 		 692 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.16 
 
 		 731 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  39.75 
 
 		 651 aa  334  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  42.33 
 
 		 679 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  34.34 
 
 		 691 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  39.71 
 
 		 686 aa  324  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  37.5 
 
 		 671 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  40.41 
 
 		 676 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  35.78 
 
 		 736 aa  293  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  40.99 
 
 		 672 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  37.48 
 
 		 719 aa  279  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  45.54 
 
 		 661 aa  273  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  35.46 
 
 		 642 aa  264  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  34.89 
 
 		 646 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  37.96 
 
 		 632 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  35.48 
 
 		 641 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  35.48 
 
 		 641 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  33.57 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  34.65 
 
 		 653 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.9 
 
 		 654 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  37.12 
 
 		 310 aa  197  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  36.93 
 
 		 328 aa  190  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  42.25 
 
 		 319 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  40.37 
 
 		 322 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.07 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  36.93 
 
 		 322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  35.33 
 
 		 651 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.63 
 
 		 613 aa  144  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  34.25 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  34.71 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  34.25 
 
 		 331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  34.36 
 
 		 326 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  34.84 
 
 		 308 aa  138  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  34.81 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  30.39 
 
 		 387 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.8 
 
 		 307 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  28.2 
 
 		 277 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  28.84 
 
 		 265 aa  101  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  28.2 
 
 		 277 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  28.2 
 
 		 277 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  41.84 
 
 		 273 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  28.09 
 
 		 274 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  28.49 
 
 		 354 aa  91.3  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30.27 
 
 		 254 aa  90.1  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  29.06 
 
 		 604 aa  85.1  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.42 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.04 
 
 		 394 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.86 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  33.81 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  32.7 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  33.93 
 
 		 235 aa  62  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  38.1 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  34.19 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.5 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  25.36 
 
 		 264 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  26.19 
 
 		 315 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  34.25 
 
 		 309 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  34.25 
 
 		 309 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  24.1 
 
 		 296 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  25.24 
 
 		 265 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  41.44 
 
 		 309 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  37.5 
 
 		 310 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  24.44 
 
 		 280 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  24.27 
 
 		 270 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.51 
 
 		 289 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  35.5 
 
 		 607 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  34.73 
 
 		 339 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 571 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  24.59 
 
 		 547 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  25.79 
 
 		 294 aa  47.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.77 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  23.77 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.77 
 
 		 544 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  23.77 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  37.5 
 
 		 297 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.7 
 
 		 291 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  25.69 
 
 		 439 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>