More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4541 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 		 604 aa  1201    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  76.51 
 
 		 585 aa  813    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  64.95 
 
 		 567 aa  739    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  69.38 
 
 		 567 aa  744    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  50 
 
 		 558 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.45 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  47.73 
 
 		 588 aa  485  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  48.66 
 
 		 560 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  47.87 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  46.76 
 
 		 555 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  47.31 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.25 
 
 		 578 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  45.75 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  44.72 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  44.5 
 
 		 655 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  40.77 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  41.55 
 
 		 580 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  42.02 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.89 
 
 		 722 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  42.31 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  41.48 
 
 		 578 aa  363  7.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  38.18 
 
 		 597 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  39.46 
 
 		 571 aa  330  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.25 
 
 		 530 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  34.68 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  34.68 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  34.5 
 
 		 529 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  34.5 
 
 		 529 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  34.62 
 
 		 529 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  34.68 
 
 		 529 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  34.5 
 
 		 529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  34.56 
 
 		 529 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  35.45 
 
 		 529 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  38.78 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  35.45 
 
 		 529 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  34.13 
 
 		 529 aa  300  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.09 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.87 
 
 		 529 aa  298  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.45 
 
 		 560 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  36.45 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.78 
 
 		 561 aa  266  8e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  33.62 
 
 		 580 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.4 
 
 		 571 aa  241  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 578 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  30.74 
 
 		 574 aa  234  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  30.03 
 
 		 575 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  31.93 
 
 		 580 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  33.56 
 
 		 583 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.92 
 
 		 586 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  31.85 
 
 		 1512 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.75 
 
 		 731 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.83 
 
 		 1577 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  30.69 
 
 		 581 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  31.19 
 
 		 752 aa  206  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  33.22 
 
 		 1652 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.38 
 
 		 504 aa  198  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.1 
 
 		 1525 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  33.94 
 
 		 870 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  32.11 
 
 		 1577 aa  193  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  29.25 
 
 		 690 aa  192  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30.99 
 
 		 1506 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  32.21 
 
 		 1591 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  29.69 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  28.64 
 
 		 1311 aa  171  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.03 
 
 		 1181 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.84 
 
 		 1175 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.11 
 
 		 1284 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29.25 
 
 		 581 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.17 
 
 		 1202 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.08 
 
 		 1215 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.03 
 
 		 508 aa  157  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.03 
 
 		 508 aa  157  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  27.68 
 
 		 765 aa  153  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.76 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 872 aa  150  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  28.09 
 
 		 826 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.36 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 		 530 aa  147  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.31 
 
 		 605 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 607 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.1 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  29.31 
 
 		 558 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.54 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  27.98 
 
 		 518 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.57 
 
 		 601 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.06 
 
 		 587 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  25.34 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.33 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>