More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4405 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  100 
 
 		 224 aa  431  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  69.48 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  66.05 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  67.65 
 
 		 271 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  60.98 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  61.19 
 
 		 279 aa  244  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  57.14 
 
 		 269 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  59.41 
 
 		 445 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  59.63 
 
 		 266 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  60.83 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  59.9 
 
 		 455 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  55.61 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  57.87 
 
 		 252 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  58.41 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  60.56 
 
 		 245 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.66 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  61.17 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  65.2 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  63.68 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  58.25 
 
 		 255 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  57.08 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  53.95 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  55.61 
 
 		 279 aa  228  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  55.67 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  57.21 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  59.61 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  53.95 
 
 		 255 aa  227  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  55.71 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  54.33 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 262 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  60.71 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 255 aa  224  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  57.21 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  55.5 
 
 		 291 aa  223  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  56.16 
 
 		 259 aa  222  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  58.5 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 249 aa  221  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  59.7 
 
 		 277 aa  220  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  61.08 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  56 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  56.16 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  64.32 
 
 		 277 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.67 
 
 		 264 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.35 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  59.61 
 
 		 268 aa  214  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  54.5 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  54.73 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  53.7 
 
 		 255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  55.17 
 
 		 271 aa  211  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  60 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.94 
 
 		 269 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  58.65 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  46.12 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.55 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  57.62 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  54.23 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  55.61 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  54.73 
 
 		 258 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  56.57 
 
 		 288 aa  205  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  52.58 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  45.97 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.73 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  49.32 
 
 		 653 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  49.07 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  55.22 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  55.39 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  48.61 
 
 		 228 aa  201  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  47.49 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  58.91 
 
 		 302 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.12 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.29 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  52.8 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.26 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  51.17 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  40.99 
 
 		 229 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  54.07 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  48.54 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  58.53 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 247 aa  197  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  50 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  47.71 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  49.01 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.64 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  46.45 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  47.66 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  45.83 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  56.37 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  42.11 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.98 
 
 		 648 aa  194  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  52 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  46.05 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>