More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4354 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 431 aa  839    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 		 418 aa  326  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 420 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 441 aa  309  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  43.56 
 
 		 413 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 		 417 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  44 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  42.02 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  43.64 
 
 		 419 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 457 aa  286  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  43.35 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.1 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 413 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 428 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  42.05 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  41.07 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  44.93 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 		 476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  41.02 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 419 aa  260  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  38.08 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 428 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 431 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 412 aa  239  8e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 426 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 491 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  35.88 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.47 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 474 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  35.08 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  31.65 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.9 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  30.53 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  27.53 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 441 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  32.55 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  29.61 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  27.49 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>