More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4305 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.6 
 
 		 745 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.8 
 
 		 713 aa  701    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.13 
 
 		 718 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.48 
 
 		 691 aa  735    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 724 aa  1415    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.57 
 
 		 756 aa  737    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.96 
 
 		 766 aa  820    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.83 
 
 		 979 aa  835    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.36 
 
 		 754 aa  740    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.51 
 
 		 734 aa  730    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.66 
 
 		 712 aa  738    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.11 
 
 		 706 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  63.23 
 
 		 691 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.8 
 
 		 788 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.42 
 
 		 749 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.48 
 
 		 691 aa  738    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.6 
 
 		 689 aa  785    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  60.29 
 
 		 691 aa  721    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.57 
 
 		 741 aa  656    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.43 
 
 		 723 aa  813    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.18 
 
 		 708 aa  711    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.03 
 
 		 712 aa  712    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.08 
 
 		 729 aa  710    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.96 
 
 		 733 aa  799    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.15 
 
 		 714 aa  843    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.48 
 
 		 691 aa  738    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.55 
 
 		 704 aa  747    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.12 
 
 		 762 aa  620  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.97 
 
 		 706 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.65 
 
 		 698 aa  550  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.87 
 
 		 708 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.2 
 
 		 693 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.6 
 
 		 697 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.72 
 
 		 706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.99 
 
 		 679 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.13 
 
 		 698 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.44 
 
 		 756 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.95 
 
 		 698 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.7 
 
 		 699 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.98 
 
 		 695 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.94 
 
 		 698 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 		 697 aa  485  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.85 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.34 
 
 		 691 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.35 
 
 		 693 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 		 448 aa  257  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.71 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.71 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.5 
 
 		 543 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.15 
 
 		 1376 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.49 
 
 		 602 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.11 
 
 		 626 aa  216  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.09 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.81 
 
 		 624 aa  210  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.55 
 
 		 545 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.84 
 
 		 625 aa  204  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.09 
 
 		 557 aa  203  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.4 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.53 
 
 		 588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.19 
 
 		 725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.4 
 
 		 600 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 		 633 aa  201  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  33.63 
 
 		 669 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.91 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.91 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.58 
 
 		 646 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.4 
 
 		 556 aa  197  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.01 
 
 		 546 aa  197  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.91 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.5 
 
 		 419 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 736 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.96 
 
 		 596 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1455  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.82 
 
 		 651 aa  195  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.865636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.91 
 
 		 748 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.91 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  30.43 
 
 		 493 aa  194  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.77 
 
 		 665 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.56 
 
 		 637 aa  194  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  35.71 
 
 		 679 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.64 
 
 		 609 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.69 
 
 		 630 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.06 
 
 		 594 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.27 
 
 		 607 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.96 
 
 		 659 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.52 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.54 
 
 		 563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 616 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  39.24 
 
 		 637 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.07 
 
 		 708 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.01 
 
 		 607 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  33.16 
 
 		 734 aa  191  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.24 
 
 		 636 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.2 
 
 		 716 aa  190  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.29 
 
 		 618 aa  190  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  35.57 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.28 
 
 		 731 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.2 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 		 606 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.45 
 
 		 630 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>