More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4256 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
519 aa  986    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.71 
 
 
487 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.1 
 
 
509 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.09 
 
 
505 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.17 
 
 
499 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.22 
 
 
514 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  59.83 
 
 
501 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.2 
 
 
788 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.98 
 
 
512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  56.96 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.91 
 
 
498 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.62 
 
 
519 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.91 
 
 
499 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.86 
 
 
500 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 
506 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.3 
 
 
504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.37 
 
 
487 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.15 
 
 
508 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  45.88 
 
 
487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.93 
 
 
503 aa  310  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.15 
 
 
498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.63 
 
 
488 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  41.81 
 
 
490 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0447  major facilitator superfamily MFS_1  49.26 
 
 
470 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00443315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.32 
 
 
488 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00960  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.33 
 
 
475 aa  277  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 
763 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3988  major facilitator transporter  44.78 
 
 
482 aa  274  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.69 
 
 
493 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.66 
 
 
527 aa  259  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  40.08 
 
 
492 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
487 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
491 aa  251  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.59 
 
 
553 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.22 
 
 
534 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5575  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 
469 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.8 
 
 
530 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.42 
 
 
507 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 
490 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.96 
 
 
487 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  38.31 
 
 
497 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 
487 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  39.69 
 
 
492 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.77 
 
 
501 aa  232  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.77 
 
 
479 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.95 
 
 
1112 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.07 
 
 
496 aa  227  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  37.72 
 
 
470 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
528 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.56 
 
 
474 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.45 
 
 
519 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.17 
 
 
506 aa  223  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  36.73 
 
 
475 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.57 
 
 
522 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  41.88 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.63 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.26 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  35.87 
 
 
481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  38.39 
 
 
483 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 
513 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
733 aa  217  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.65 
 
 
583 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.51 
 
 
505 aa  216  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.97 
 
 
489 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  36.43 
 
 
530 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.5 
 
 
522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 
532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.06 
 
 
479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  41.12 
 
 
482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.06 
 
 
479 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.06 
 
 
479 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
478 aa  213  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 
646 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 
646 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 
646 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
522 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  38.06 
 
 
498 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.69 
 
 
757 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.15 
 
 
519 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.6 
 
 
482 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.6 
 
 
482 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.85 
 
 
487 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.25 
 
 
534 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.69 
 
 
478 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 
518 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 
532 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.23 
 
 
497 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 
543 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.63 
 
 
502 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  37.72 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 
480 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  40.09 
 
 
480 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.27 
 
 
626 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.47 
 
 
489 aa  201  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  40.09 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.43 
 
 
529 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.25 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>