More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4225 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  53.59 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  42.4 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  48.08 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 194 aa  141  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  41.38 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  38.97 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  40 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  39.7 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  43.35 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  40.89 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  35.95 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  35.1 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5872  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  36.71 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2850  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  27.01 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>