131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4181 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  46.67 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 181 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  42.38 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 		 283 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  43.7 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  39.52 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  41.01 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  40.6 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  41.61 
 
 		 173 aa  87.8  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  38.89 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  38.13 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  40 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  35.34 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  34.43 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  32.56 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  31.45 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  33.58 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  32.85 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  31.01 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.82 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  37.27 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  24.81 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  38.94 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  25.56 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>