104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4178 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  100 
 
 		 135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  67.41 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  67.42 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  67.42 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  66.41 
 
 		 133 aa  163  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  62.22 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  65.38 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  62.88 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  62.96 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  62.41 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  58.33 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  60.61 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  62.02 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  63.36 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  60 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  61.72 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  62.79 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  60.15 
 
 		 132 aa  143  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  65.15 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  62.02 
 
 		 132 aa  137  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  56.49 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  58.59 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  57.25 
 
 		 132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  58.82 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  54.74 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  54.01 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  56 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  46.03 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  31.25 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  49.25 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  42.86 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  42.25 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  38.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  32.39 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  44.64 
 
 		 59 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  42.86 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1172  TOBE domain-containing protein  43.55 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 452 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  34.21 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  43.75 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  40.24 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0263  TOBE domain-containing protein  34.38 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0977  TOBE domain-containing protein  37.5 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1651  TOBE domain-containing protein  32.81 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.8226  normal  0.692606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 266 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  37.84 
 
 		 264 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  32.81 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  38.81 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.51 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  34.15 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  35.48 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2166  TOBE domain protein  31.76 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2228  TOBE domain protein  31.76 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 262 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  49.18 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 268 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  39.39 
 
 		 262 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  41.27 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  34.12 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  36.36 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  32.61 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  36.23 
 
 		 282 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  35.29 
 
 		 438 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  36.23 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  36.23 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  36.23 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  36.23 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  36.23 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2403  TOBE domain protein  36.92 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  39.73 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  36.23 
 
 		 262 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  41.27 
 
 		 141 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  34.78 
 
 		 282 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  34.33 
 
 		 142 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  36.67 
 
 		 364 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  42.19 
 
 		 141 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  40.3 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 290 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  36.14 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  31.18 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  38.1 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  30.16 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4993  TOBE domain protein  38.1 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0998  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  41.94 
 
 		 364 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  36.51 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 276 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  35.94 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  36.51 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  36.51 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>