More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4150 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.41 
 
 
503 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 
503 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  53.78 
 
 
273 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  58.11 
 
 
271 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  53.88 
 
 
489 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.88 
 
 
489 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.47 
 
 
489 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.57 
 
 
262 aa  229  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  47.75 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  43.13 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  43.13 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.02 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.02 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  48.2 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.53 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  42.53 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.53 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.53 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  42.53 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  46.38 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.15 
 
 
265 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 
265 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  47.75 
 
 
257 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  46.85 
 
 
255 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.15 
 
 
265 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.15 
 
 
265 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  43.63 
 
 
257 aa  215  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  41.67 
 
 
256 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.76 
 
 
265 aa  214  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.94 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  45.58 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  48.21 
 
 
260 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 
260 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 
260 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  45.5 
 
 
257 aa  211  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  39.54 
 
 
256 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  45.95 
 
 
261 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  43.5 
 
 
257 aa  208  9e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 
278 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  44.14 
 
 
250 aa  203  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.02 
 
 
483 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  43.69 
 
 
250 aa  199  6e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  40.93 
 
 
281 aa  198  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.17 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  41.26 
 
 
260 aa  195  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  41.88 
 
 
252 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  41.78 
 
 
260 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.22 
 
 
260 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  40.09 
 
 
250 aa  187  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  33.46 
 
 
259 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 
253 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  36.12 
 
 
264 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  34.8 
 
 
264 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.73 
 
 
264 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 
270 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 
270 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
264 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 
264 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  34.35 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  36.03 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  35.68 
 
 
264 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  35.68 
 
 
264 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.73 
 
 
264 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  36 
 
 
265 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
264 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  31.11 
 
 
502 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  31.11 
 
 
502 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.21 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
264 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 
266 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.84 
 
 
266 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 
266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 
266 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
266 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
266 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  35.93 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.88 
 
 
266 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  36.14 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  34.33 
 
 
266 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  34.33 
 
 
266 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  34.33 
 
 
266 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  29.85 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  36.24 
 
 
266 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  36.24 
 
 
320 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  36.24 
 
 
315 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  33.33 
 
 
266 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>