61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4143 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  100 
 
 		 213 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  52.13 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  51.52 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  48.17 
 
 		 287 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  50 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  47.57 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  45 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  49.47 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  46.07 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  46.81 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  50.85 
 
 		 295 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  46.52 
 
 		 256 aa  154  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  45.3 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  48.57 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  50.27 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  45.1 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  42 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  50.85 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  50.85 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  50.85 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  50 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  45.21 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  50.79 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  47.26 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  47.57 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  35.61 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  53.26 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  53.26 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  38.46 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  36.52 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  43.85 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  43.39 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  34.62 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  32.79 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  35.33 
 
 		 218 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  32.07 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  29.03 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  27.92 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  27.41 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  31.85 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  31.21 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  32.48 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  31.21 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  31.21 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  31.21 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  31.21 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  31.21 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  31.21 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  23.5 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  26.06 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  26.06 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  27.98 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  25.53 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  24.53 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  24.53 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  27.67 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  25.41 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  25.25 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0973  hypothetical protein  24.55 
 
 		 216 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0948172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>