86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4136 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4136  protein of unknown function DUF990  100 
 
 		 272 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3152  protein of unknown function DUF990  58.65 
 
 		 267 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.129071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12830  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  58.94 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.75127  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3918  protein of unknown function DUF990  43.18 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373392  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09760  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  43.87 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6486  protein of unknown function DUF990  43.08 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4780  protein of unknown function DUF990  40.87 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.723474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4152  hypothetical protein  39.23 
 
 		 269 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2071  hypothetical protein  42.36 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151381  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1067  hypothetical protein  41.05 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1830  hypothetical protein  31.8 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5807  hypothetical protein  40.17 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2492  protein of unknown function DUF990  40.09 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000365618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4687  protein of unknown function DUF990  38.58 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3437  hypothetical protein  39.29 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.434658  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0442  protein of unknown function DUF990  27.69 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0572285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2386  protein of unknown function DUF990  32.45 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3778  hypothetical protein  25.38 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000127963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0524  hypothetical protein  29.37 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2675  hypothetical protein  25.69 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.187559  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1921  hypothetical protein  29.66 
 
 		 315 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0485  hypothetical protein  27.1 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0184092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0488  protein of unknown function DUF990  23.02 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0436  hypothetical protein  24.52 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0980  hypothetical protein  27.01 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0590  putative ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.70299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0589  ABC transporter, permease protein, putative  22.18 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0539  putative ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0456  hypothetical protein  22.18 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0445  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0502  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0517  putative ABC transporter, permease protein  22.18 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000033063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0441  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0534  ABC transporter permease  22.18 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0450  hypothetical protein  21.79 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4787  putative ABC transporter, permease protein  21.79 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.14133  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1360  protein of unknown function DUF990  21.51 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2520  protein of unknown function DUF990  20.7 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0173  hypothetical protein  20.38 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.109206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0170  hypothetical protein  20 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2521  protein of unknown function DUF990  27.17 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  normal  0.519052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0859  hypothetical protein  26.56 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1285  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  24.55 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0661  hypothetical protein  24.55 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.788347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0552  hypothetical protein  23.9 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.268475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2222  protein of unknown function DUF990  25.93 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0538  protein of unknown function DUF990  23.9 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1188  hypothetical protein  24.52 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0983  membrane protein, multidrug efflux associated  20.59 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.594121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1946  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0400  hypothetical protein  27.66 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0236  membrane protein, multidrug efflux associated  24.32 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0428  protein of unknown function DUF990  29.47 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.502451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0803  hypothetical protein  27.52 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.386631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2348  protein of unknown function DUF990  22.96 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.671406  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09031  membrane protein, multidrug efflux associated  24.32 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0060  protein of unknown function DUF990  24.71 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0058  protein of unknown function DUF990  24.71 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  21.59 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.826681  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29101  membrane protein, multidrug efflux associated  29.07 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4243  protein of unknown function DUF990  26.56 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  hitchhiker  0.000000472555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2321  protein of unknown function DUF990  21.84 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2209  membrane protein, multidrug efflux associated  28.51 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1130  hypothetical protein  24.43 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1443  protein of unknown function DUF990  23.94 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3771  protein of unknown function DUF990  23.46 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.616684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1498  hypothetical protein  22.64 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3098  protein of unknown function DUF990  27.27 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0429  protein of unknown function DUF990  27.13 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1964  protein of unknown function DUF990  22.01 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000269589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2387  protein of unknown function DUF990  29.51 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10541  membrane protein, multidrug efflux associated  22.12 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0658  protein of unknown function DUF990  25.49 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260667 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2555  membrane protein, multidrug efflux associated  27.4 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2816  protein of unknown function DUF990  27.49 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0376428 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10531  membrane protein, multidrug efflux associated  20.7 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1505  protein of unknown function DUF990  17.52 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  hitchhiker  0.00000124255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4171  hypothetical protein  28.49 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.068951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2550  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  32.99 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0886  hypothetical protein  25.88 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0866325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0892  ABC transporter, permease protein  20.54 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0739  protein of unknown function DUF990  21.43 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0545  protein of unknown function DUF990  26.15 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.931228  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3537  hypothetical protein  24.06 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3393  conserved membrane protein, putative multidrug efflux associated  20.94 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120768  hitchhiker  0.0000000768591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1922  hypothetical protein  33.02 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>