More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4130 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.36 
 
 		 947 aa  956    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.86 
 
 		 995 aa  849    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.23 
 
 		 950 aa  952    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  51.1 
 
 		 987 aa  841    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.35 
 
 		 1050 aa  929    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.93 
 
 		 977 aa  688    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  50.68 
 
 		 976 aa  841    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.75 
 
 		 948 aa  915    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  45.48 
 
 		 949 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.23 
 
 		 966 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  53.26 
 
 		 989 aa  895    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  42.84 
 
 		 984 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  54.22 
 
 		 1010 aa  964    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 		 976 aa  673    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.82 
 
 		 944 aa  920    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 975 aa  1954    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.02 
 
 		 973 aa  1002    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  45.98 
 
 		 1050 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  56.22 
 
 		 985 aa  969    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.73 
 
 		 1006 aa  961    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.8 
 
 		 1031 aa  756    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  56.84 
 
 		 974 aa  1018    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.75 
 
 		 945 aa  862    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 999 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  41.72 
 
 		 1013 aa  715    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  44.4 
 
 		 1024 aa  735    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  55.28 
 
 		 997 aa  983    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  51.38 
 
 		 894 aa  767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  44.08 
 
 		 1015 aa  754    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.2 
 
 		 1028 aa  759    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  45.9 
 
 		 993 aa  737    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.04 
 
 		 1022 aa  799    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  45.71 
 
 		 1052 aa  717    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.1 
 
 		 997 aa  860    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.06 
 
 		 999 aa  675    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.37 
 
 		 906 aa  814    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.5 
 
 		 1000 aa  719    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  45.97 
 
 		 1043 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.83 
 
 		 1037 aa  800    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  45.7 
 
 		 1050 aa  719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.19 
 
 		 978 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.07 
 
 		 976 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  34.54 
 
 		 973 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.4 
 
 		 1007 aa  483  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.35 
 
 		 1005 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  36.4 
 
 		 952 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  32.12 
 
 		 975 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.1 
 
 		 991 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 962 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  34.74 
 
 		 1007 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.51 
 
 		 995 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  34.34 
 
 		 984 aa  459  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.43 
 
 		 990 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 983 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.57 
 
 		 1025 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.71 
 
 		 983 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.92 
 
 		 990 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  34.24 
 
 		 1014 aa  449  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.3 
 
 		 1038 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.16 
 
 		 1046 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.5 
 
 		 1009 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  33.66 
 
 		 1055 aa  442  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.57 
 
 		 1035 aa  440  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.36 
 
 		 977 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.86 
 
 		 990 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 1025 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 996 aa  439  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.29 
 
 		 976 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.83 
 
 		 1032 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  33.6 
 
 		 1024 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  35.38 
 
 		 974 aa  429  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  31.3 
 
 		 967 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.35 
 
 		 989 aa  425  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.44 
 
 		 1032 aa  424  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.8 
 
 		 1034 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 961 aa  425  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.63 
 
 		 971 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.99 
 
 		 1015 aa  422  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  32.28 
 
 		 1070 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  33.71 
 
 		 967 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.9 
 
 		 968 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.37 
 
 		 1023 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  32.47 
 
 		 973 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.83 
 
 		 1011 aa  406  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  33.54 
 
 		 1023 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  31.61 
 
 		 930 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  26.82 
 
 		 1002 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.92 
 
 		 1006 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  32.92 
 
 		 978 aa  348  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.5 
 
 		 1013 aa  344  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.1 
 
 		 1013 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  29.16 
 
 		 1021 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 1013 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.31 
 
 		 1013 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 		 1013 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1023 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 1013 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 		 1023 aa  335  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2071  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.77 
 
 		 1007 aa  334  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.999206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.75 
 
 		 1013 aa  333  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>