65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4065 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  51.02 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  47.31 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  51.16 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  46.51 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  42.11 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  45.56 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  40.86 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  40 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  42.17 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  44 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  39.13 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  43.01 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  39.13 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  35.37 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  38.04 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  35.05 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  35.64 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  33.68 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  36.63 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  36.08 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0803  hypothetical protein  36.96 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  33.7 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  35.11 
 
 		 330 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  33.7 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  33.7 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  45.83 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  34.09 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3014  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  29.67 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0765911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0771  hypothetical protein  40.45 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  32.29 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  30.23 
 
 		 332 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  35.56 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  30 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4890  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.040811  normal  0.40753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  30.23 
 
 		 325 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  28.16 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  32.61 
 
 		 327 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  34.69 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  30.59 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  40 
 
 		 106 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  34.41 
 
 		 101 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>