More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4034 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
231 aa  457  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.17 
 
 
232 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.7 
 
 
231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
234 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
234 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.1 
 
 
237 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  54.04 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 
249 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.78 
 
 
245 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
246 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
272 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
251 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
260 aa  170  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
270 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
241 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  43.15 
 
 
240 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
241 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
250 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
263 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  40.85 
 
 
245 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
246 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
244 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
242 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
247 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
244 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
236 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
236 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
227 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  36 
 
 
245 aa  131  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
238 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
240 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
229 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.62 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
236 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
307 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 
307 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
237 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
250 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
239 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  34.17 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
232 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  31.65 
 
 
242 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
271 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.54 
 
 
271 aa  101  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  35.07 
 
 
263 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
236 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
236 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
285 aa  98.6  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
277 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
279 aa  95.5  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
228 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
287 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
272 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  35.15 
 
 
302 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 
287 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  40 
 
 
279 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
268 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
281 aa  92.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
270 aa  92  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
272 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 
274 aa  92  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
243 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  42.22 
 
 
278 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  32.64 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  31.39 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.49 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
281 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
270 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.65 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
304 aa  89.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>