More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3962 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
298 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.9 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.77 
 
 
261 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  51.22 
 
 
283 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.55 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  53.14 
 
 
273 aa  281  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.6 
 
 
272 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  49.06 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.1 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
277 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.74 
 
 
302 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
306 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  44.95 
 
 
291 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  39.1 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 
280 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.67 
 
 
304 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.99 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
275 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 
298 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.55 
 
 
306 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
303 aa  203  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
296 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  41.48 
 
 
292 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
297 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  38.61 
 
 
278 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  36.79 
 
 
297 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.84 
 
 
278 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
271 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
270 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.28 
 
 
269 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  36.63 
 
 
306 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
275 aa  188  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
284 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
268 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  35.42 
 
 
277 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
295 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.88 
 
 
302 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
294 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.45 
 
 
299 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
279 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
276 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  39.7 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  41.27 
 
 
295 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.91 
 
 
295 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
246 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
271 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
275 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  37.55 
 
 
277 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
290 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
281 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
300 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  34.83 
 
 
294 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
303 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
390 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
270 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
300 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
283 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
290 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
274 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
295 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.96 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  37.66 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.71 
 
 
291 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
271 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.27 
 
 
297 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
289 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  32.21 
 
 
281 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
271 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.66 
 
 
278 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
294 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  35.83 
 
 
287 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
297 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  30.59 
 
 
308 aa  159  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
292 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
295 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
298 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
275 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
271 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000194486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.1 
 
 
296 aa  158  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
301 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
281 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
291 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.36 
 
 
350 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
285 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
285 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>