286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3889 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  100 
 
 
395 aa  764    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  49.19 
 
 
448 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  39.22 
 
 
478 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  39.58 
 
 
436 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  37.44 
 
 
404 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  39.03 
 
 
407 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  39.03 
 
 
407 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  39.03 
 
 
407 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  37.82 
 
 
404 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  32.1 
 
 
433 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  30.03 
 
 
367 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  30.79 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  28.87 
 
 
365 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  30.03 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  28.76 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  27.69 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  31.49 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.14 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  30.1 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  27.93 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.86 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  29.95 
 
 
658 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.15 
 
 
640 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  30.67 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  19.65 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  28.61 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  25.86 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  32.18 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  23.94 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  27.3 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  26.2 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.17 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  30.67 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  25.38 
 
 
695 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.3 
 
 
638 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  30 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  27.14 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  27.71 
 
 
667 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  28.97 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  30.37 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  31.4 
 
 
364 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  30.09 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  23.38 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  34.78 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  27.84 
 
 
673 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.39 
 
 
665 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.95 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  25.65 
 
 
656 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  24.32 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  29.29 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  26.58 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  26.33 
 
 
679 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  27.11 
 
 
695 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  28.15 
 
 
681 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  27.44 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  26.58 
 
 
658 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  25 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  29.02 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  29.02 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  23.6 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.16 
 
 
622 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  22.11 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  29.9 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  28.5 
 
 
372 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  27.91 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  23.08 
 
 
660 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.35 
 
 
629 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  28.95 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  26.97 
 
 
645 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  23.65 
 
 
657 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.35 
 
 
647 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  26.93 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  24 
 
 
637 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  31.84 
 
 
356 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  26.29 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  26.93 
 
 
375 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  26.84 
 
 
716 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  26.93 
 
 
375 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  30 
 
 
688 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  23.32 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  30.49 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  24.35 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  25.85 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  25.14 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  24.93 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  23.14 
 
 
657 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.28 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  28.49 
 
 
363 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1288  acyltransferase 3  27.84 
 
 
423 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.463574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  29.21 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  24.26 
 
 
348 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  27.54 
 
 
760 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  32.43 
 
 
312 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  28.13 
 
 
662 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  25.07 
 
 
615 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  25.6 
 
 
658 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  24.56 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  27.17 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  27 
 
 
378 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  24.2 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>