54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3880 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  100 
 
 		 375 aa  701    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.48 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  28.92 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  33.8 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  33.8 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  33.8 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  29.9 
 
 		 477 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  30.94 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  29.81 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  30.77 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  31.38 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  28.47 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  31.42 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  31.19 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  31.79 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  32.51 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  30.34 
 
 		 430 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  30.03 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  29.63 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  29.23 
 
 		 570 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  30.03 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  35.62 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  30.7 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  30.37 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  30.37 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  31.72 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  31.72 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  31.72 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  29.82 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  30.74 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  33 
 
 		 421 aa  67  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  29.88 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  30.07 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  30.55 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  29.63 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  28.44 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  31.29 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  31.29 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  31.29 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  30.13 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  27.76 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  27.42 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  31.11 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  31.63 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  30.34 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  30.26 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  29.26 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  29.26 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  29.26 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  29.28 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  30.34 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  39.06 
 
 		 463 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>