26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3874 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3874  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  980    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0638  hypothetical protein  33.71 
 
 		 567 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.458484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11651  transmembrane protein  30.04 
 
 		 565 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1008  hypothetical protein  30.96 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0217006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0468  hypothetical protein  29.48 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0677417  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8450  membrane protein-like protein  38.58 
 
 		 506 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  23.84 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4086  hypothetical protein  32.13 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00423288  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0862  hypothetical protein  31.96 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  33.52 
 
 		 536 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5173  membrane protein-like protein  29.61 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4105  putative mannosyltransferase  27.16 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3705  hypothetical protein  34.11 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5993  membrane protein-like protein  29.58 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0314431  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  30.52 
 
 		 546 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  27.67 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  28.66 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  34.94 
 
 		 543 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0213  hypothetical protein  28.7 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  28.14 
 
 		 528 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  28.14 
 
 		 528 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  31.34 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0769  hypothetical protein  33.14 
 
 		 590 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0333554  hitchhiker  0.00590563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  37.36 
 
 		 658 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>