26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3864 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  40 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  42.32 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  41.03 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  48.04 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  45.83 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  42.45 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  41.87 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  45.69 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  38.57 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  37.55 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  44.73 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  43.4 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  43.22 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  39.11 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  37.04 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  27.1 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  27.21 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  32.89 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  30.25 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  24.51 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  21.2 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05521  hypothetical protein  18.51 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  18.51 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  20.86 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  22.74 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>