More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3838 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.52 
 
 		 478 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  67.49 
 
 		 489 aa  649    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.08 
 
 		 495 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  70.45 
 
 		 498 aa  680    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  72.02 
 
 		 476 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.08 
 
 		 492 aa  713    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.61 
 
 		 478 aa  744    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.69 
 
 		 485 aa  715    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  71.34 
 
 		 485 aa  701    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.54 
 
 		 512 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.27 
 
 		 519 aa  709    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 487 aa  994    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  71.77 
 
 		 506 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  71.4 
 
 		 483 aa  701    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  72.48 
 
 		 495 aa  706    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.9 
 
 		 489 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.3 
 
 		 478 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.78 
 
 		 494 aa  658    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.37 
 
 		 491 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  71.81 
 
 		 475 aa  702    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  75.2 
 
 		 478 aa  726    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.23 
 
 		 496 aa  712    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.7 
 
 		 489 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  69.61 
 
 		 475 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.49 
 
 		 486 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  72.02 
 
 		 484 aa  698    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.62 
 
 		 492 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.59 
 
 		 485 aa  725    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.42 
 
 		 493 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.99 
 
 		 476 aa  677    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.53 
 
 		 476 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.7 
 
 		 489 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  67.7 
 
 		 485 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.58 
 
 		 490 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.3 
 
 		 498 aa  661    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  68.58 
 
 		 488 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.31 
 
 		 486 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.46 
 
 		 496 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.81 
 
 		 491 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.81 
 
 		 491 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.2 
 
 		 491 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0049  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.02 
 
 		 509 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4291  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.6 
 
 		 466 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.81 
 
 		 466 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.82 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.6 
 
 		 466 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.78 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2682  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.41 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.93 
 
 		 466 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.6 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.6 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2964  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.81 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317218  normal  0.0707693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.11 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.32 
 
 		 466 aa  561  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.7 
 
 		 465 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60 
 
 		 476 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.74 
 
 		 472 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.47 
 
 		 472 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.92 
 
 		 476 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.61 
 
 		 471 aa  549  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.83 
 
 		 476 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.91 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.46 
 
 		 469 aa  551  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.08 
 
 		 476 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.73 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3426  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.84 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.97 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.76 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.61 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.67 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.92 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0119  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.45 
 
 		 477 aa  544  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.96 
 
 		 465 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.34 
 
 		 481 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.73 
 
 		 480 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.92 
 
 		 476 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.73 
 
 		 480 aa  544  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  58.7 
 
 		 512 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.76 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.29 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.29 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.76 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  56.5 
 
 		 481 aa  539  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.79 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.23 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.47 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.1 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.23 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.1 
 
 		 472 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15851  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.58 
 
 		 471 aa  538  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.26 
 
 		 479 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.94 
 
 		 471 aa  538  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3286  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.59 
 
 		 477 aa  538  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.19663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.35 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.8 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.415255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.68 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4943  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.47 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  normal  0.487152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.14 
 
 		 465 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.47 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.23 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>