More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3814 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
539 aa  1046    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  48.85 
 
 
597 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  56.11 
 
 
587 aa  465  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
601 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  49.81 
 
 
544 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  49.09 
 
 
608 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.28 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.72 
 
 
575 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  48.65 
 
 
586 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  50.28 
 
 
594 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  51.07 
 
 
557 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  49.42 
 
 
594 aa  425  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  47.57 
 
 
574 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 
605 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  48.34 
 
 
579 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 
589 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  49.71 
 
 
557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  45.49 
 
 
558 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  44.3 
 
 
567 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.4 
 
 
547 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.77 
 
 
579 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
555 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  42.5 
 
 
557 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
555 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
552 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.44 
 
 
551 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
577 aa  379  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  43.3 
 
 
554 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  46.01 
 
 
801 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
607 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
538 aa  356  7.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  44 
 
 
572 aa  342  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  46.98 
 
 
648 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
554 aa  326  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
565 aa  320  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  36.46 
 
 
505 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.45 
 
 
460 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  37.95 
 
 
482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.92 
 
 
468 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
487 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
452 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
467 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  33.43 
 
 
364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
471 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  33.43 
 
 
364 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  27.54 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  27.54 
 
 
484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  27.54 
 
 
484 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
484 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.92 
 
 
486 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
358 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  32.08 
 
 
501 aa  161  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
484 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
484 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
484 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  27.25 
 
 
484 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
471 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
613 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.31 
 
 
463 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
425 aa  156  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
639 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
639 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  27.14 
 
 
617 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
589 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
455 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  27.14 
 
 
617 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  32.98 
 
 
473 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  27.38 
 
 
617 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  27 
 
 
617 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  27 
 
 
617 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  38.08 
 
 
594 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  26.98 
 
 
620 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
493 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
473 aa  150  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  24.92 
 
 
473 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.44 
 
 
503 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  34.17 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.79 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  26.71 
 
 
617 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
723 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
483 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
364 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
359 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
463 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
466 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  26.57 
 
 
609 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
484 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  35.6 
 
 
449 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0303  sensory box histidine kinase  26.55 
 
 
616 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
641 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
545 aa  145  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.81 
 
 
456 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.57 
 
 
464 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  24.43 
 
 
594 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
389 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
458 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  31.82 
 
 
470 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  32.76 
 
 
354 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>