More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3810 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  64.19 
 
 		 234 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.08 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  64.41 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  63.8 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  61.19 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.38 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  62.5 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  45.37 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  45.37 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  43.98 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 215 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  45.83 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5643  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3764  two component LuxR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 		 217 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 216 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  45.24 
 
 		 218 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 221 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 1648 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.01 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.72 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  43.78 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  42.66 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.29 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  41.47 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 215 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 216 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  38.53 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.01 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  40.18 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.86 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>