More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3704 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  100 
 
 		 350 aa  676    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  64.2 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  60.96 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  50.3 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  48.83 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  49.08 
 
 		 354 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  49.08 
 
 		 354 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  49.08 
 
 		 354 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  54.86 
 
 		 362 aa  332  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  48.77 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  48.77 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  48.77 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  47.55 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  48.77 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  46.63 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  43.98 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  47.85 
 
 		 354 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  50.15 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  45.45 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  42.55 
 
 		 335 aa  219  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  39.05 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  38.73 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  38.73 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  45.39 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  44.68 
 
 		 335 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  41.99 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  46.55 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  42.24 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  43.77 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 		 317 aa  196  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  39.69 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  42.14 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  31.08 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  42.44 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  32.31 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  42.12 
 
 		 314 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  41.53 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.92 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  40.5 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.27 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  31.99 
 
 		 369 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  32.5 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  31.93 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  38.82 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  34.68 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  34.38 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  43.57 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  38.57 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  34.05 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  30.14 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  30.6 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  30.6 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  33.09 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  32.63 
 
 		 316 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  32.5 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  29.89 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  25.86 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  26.3 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  26.3 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  26.59 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  26.97 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  24.56 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  26.49 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  23.37 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  23.97 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  23.37 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  23.37 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  26.91 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  23.37 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  24.32 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  27.11 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  25.72 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  25.72 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  26.04 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  27.09 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.71 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  27 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.57 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  23.18 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  30.52 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  27.65 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  31.15 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  28.04 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  23.62 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>