More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3699 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  47.75 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  42.74 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  47.89 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  51.9 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  52.13 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  45.58 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  45.62 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  50.7 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1986  Phosphoglycerate mutase  45.81 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000793068  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4997  Phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.64 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  28.89 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.56 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.8 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.22 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  28.04 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  32.68 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.16 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  34.48 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.41 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  31.65 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.66 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.53 
 
 		 382 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.76 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  33.57 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.76 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.76 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.46 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  32.37 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 186 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 203 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.74 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  34.17 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  29.58 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.58 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  31.63 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.13 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  34.64 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  34.09 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  28.75 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  28.75 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  31.84 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.7 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.9 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.03 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  33.86 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 		 442 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.04 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.09 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>